Kľúčový rozdiel medzi NAAT a PCR je v tom, že NAAT je metóda, ktorá amplifikuje genetický materiál niekoľkými spôsobmi, vrátane polymerázovej reťazovej reakcie, vytesňovania vlákien alebo amplifikácie sprostredkovanej transkripciou, zatiaľ čo PCR je metóda, ktorá amplifikuje genetický materiál iba pomocou tepelné cyklovanie.
Patogény sa identifikujú hlavne na základe amplifikácie ich genetického materiálu. Väčšina techník v tejto oblasti sa zameriava na detekciu genetického materiálu patogénu amplifikáciou špecifických sekvencií v reálnom čase. Preto sa výsledky v diagnostickom kontexte dosahujú veľmi rýchlo. NAAT, PCR, biosenzor a LCR je niekoľko techník používaných v laboratóriách na amplifikáciu genetického materiálu patogénu.
Čo je NAAT?
Test amplifikácie nukleovej kyseliny (NAAT) je metóda v molekulárnej biológii, ktorá amplifikuje genetický materiál niekoľkými spôsobmi, ako je polymerázová reťazová reakcia, amplifikácia s posunom vlákna alebo amplifikácia sprostredkovaná transkripciou. Amplifikácia genetického materiálu sa môže tiež uskutočniť pomocou techník, ako je ligačná reťazová reakcia a reakcia rozvetvenej DNA (kvantiplex b DNA) v postupe NAAT. NAAT využíva špecifickosť párovania báz Watson-Crick. V postupe NAAT sa jednovláknová sonda alebo molekula priméru hybridizuje s cieľovou molekulou DNA alebo RNA. Preto je dizajn vlákna sondy veľmi významný na zvýšenie citlivosti a špecifickosti detekcie. Potom ďalší krok NAAT amplifikuje genetický materiál vytvorením mnohých jeho kópií na detekciu.
Obrázok 01: NAAT
NAAT sa v súčasnosti používa na detekciu niekoľkých patogénov, ako sú Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis a SARS-COV2. Okrem toho je test NAAT vyvinutý na skrátenie doby okna. Obdobie okna je časové obdobie medzi tým, keď bol pacient infikovaný, a tým, keď sa test na protilátky ukázal ako pozitívny. Okrem toho skríningová metóda NAAT bola prvýkrát schválená v roku 1999 FDA. NAAT má mnoho výhod vrátane detekcie nízkych hladín DNA alebo RNA, vysokej citlivosti a vysokej špecifickosti.
Čo je to PCR?
PCR je metóda v molekulárnej biológii, ktorá zosilňuje genetický materiál iba pomocou tepelného cyklu. PCR je skratka pre polymerázovú reťazovú reakciu. Je to test na detekciu genetického materiálu zo špecifického organizmu, ako sú baktérie, huby a vírusy. Pri diagnostike ochorenia PCR zisťuje prítomnosť patogénu, ak má osoba v čase testu patogén. Pri diagnostike ochorenia má protokol PCR niekoľko krokov vrátane odberu vzorky, extrakcie DNA, PCR a sekvenovania. Pri testovaní patogénov sa zozbieraná vzorka používa na extrakciu genetického materiálu (DNA alebo RNA). Postup PCR vyžaduje špeciálne chemikálie, priméry a enzýmy, aby sa vytvorili milióny kópií genetického materiálu vo vnútri stroja PCR nazývaného tepelný cyklovač. Po amplifikácii z produktu PCR možno patogén detegovať. Vedci používajú na interpretáciu výsledkov špeciálny softvér.
Obrázok 02: PCR
Okrem toho sa v súčasnosti vo výskume používajú rôzne typy PCR. Medzi nimi je niekoľko RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD a Nested PCR. PCR je užitočná najmä pri detekcii faryngitídy (Streptokoková faryngitída), atypickej pneumónie (Chlymydia pneumoniae), osýpok (Morbillivirus), hepatitídy (HBV) a ulceróznej urogenitálnej infekcie (Haemophilus ducreyi).
Aké sú podobnosti medzi NAAT a PCR?
- NAAT a PCR sú dve dôležité molekulárne biologické metódy, ktoré sa používajú na amplifikáciu genetického materiálu.
- Nukleové kyseliny (DNA alebo RNA) sa amplifikujú oboma technikami.
- Sú to rýchle a rýchle techniky.
- Obe techniky sa v súčasnosti používajú na diagnostiku chorôb.
- Sú drahšie ako bežné metódy.
Aký je rozdiel medzi NAAT a PCR?
NAAT je metóda v molekulárnej biológii, ktorá amplifikuje genetický materiál pomocou niekoľkých metód, zatiaľ čo PCR je metóda v molekulárnej biológii, ktorá amplifikuje genetický materiál iba pomocou tepelného cyklu. NAAT používa rôzne techniky amplifikácie genetického materiálu, ako je polymerázová reťazová reakcia, amplifikácia s vytesnením vlákna, amplifikácia sprostredkovaná transkripciou, ligačná reťazová reakcia a reakcia rozvetvenej DNA (quantiplex b DNA). Na druhej strane, PCR používa rôzne techniky amplifikácie genetického materiálu, ako je RT-PCR. Multiplexná PCR, RAPD, Nested PCR. Toto je kľúčový rozdiel medzi NAAT a PCR.
Nasledujúca infografika predstavuje rozdiely medzi NAAT a PCR v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – NAAT vs PCR
V laboratóriách sa na amplifikáciu genetických materiálov používajú rôzne molekulárne biologické nástroje. NAAT, PCR, biosenzor a LCR je niekoľko takýchto techník. NAAT je molekulárna biologická technika, ktorá amplifikuje genetický materiál niekoľkými spôsobmi, ako je polymerázová reťazová reakcia, vytesnenie vlákna alebo transkripcia sprostredkovaná amplifikácia. PCR je metóda v molekulárnej biológii, ktorá amplifikuje genetický materiál pomocou tepelných cyklov. Toto je kľúčový rozdiel medzi NAAT a PCR.
