Kľúčový rozdiel medzi testom LAMP a PCR je v tom, že LAMP sa vykonáva pri konštantnej teplote (60-650C), aby sa vytvorili kópie DNA prostredníctvom amplifikácie, zatiaľ čo PCR sa vykonáva pomocou série zmien teploty na vytvorenie kópií DNA prostredníctvom amplifikácie.
LAMP a PCR sú in-vitro amplifikačné techniky používané na produkciu tisícok kópií DNA. Množstvo DNA produkovanej v LAMP je oveľa vyššie ako množstvo produkované pri technikách PCR, ako je RT-PCR. LAMP je novšia technika v porovnaní s technikou PCR. Ale pre vyškoleného vedca je to technicky jednoduché a ľahké vykonať v laboratórnych podmienkach. Vďaka tomu je to potenciálne užitočná technika na detekciu COVID-19. RT-PCR je však súčasným štandardným testom na COVID-19. Tieto techniky, hoci sú dobre známe výskumníkom a lekárom so skúsenosťami v oblasti amplifikácie DNA, môžu byť pre širšiu komunitu stále relatívne neznáme.
Čo je test LAMP?
Izotermálna amplifikácia sprostredkovaná slučkou (LAMP) pre testy COVID-19 začína odberom vzoriek z nosa alebo hrdla pomocou tampónu. Vzorky možno odobrať aj inými metódami, ako je hlien z tvrdého kašľa. Podobne ako pri technike PCR, ako je RT-PCR, vírusová RNA vo vzorke sa najskôr prevedie na DNA, čo umožňuje jej skopírovanie. Reakcia LAMP sa uskutočňuje pri konštantnej teplote (60-650C).
Amplifikácia vírusovej DNA zahŕňajúca technológiu LAMP a činidlá možno zistiť, keď sa reakčná zmes zakalí v dôsledku produkcie „pyrofosfátu horečnatého“. Táto oblačnosť umožňuje vedcom a lekárom jednoduchú diagnostiku COVID-19. Presnosť výsledkov testu sa môže zlepšiť použitím špeciálnych fluorescenčných farbív alebo farieb meniacich farbu v reakčnej zmesi. Tieto farbivá interagujú s vírusovou DNA a možno zmerať intenzitu zmeny svetla alebo farby, aby sa získal počet molekúl vírusovej RNA približne taký, aký bol pôvodne vo vzorke.
Čo je test PCR?
PCR je veľmi bežná vedecká technika, ktorá sa vo výskume a medicíne bežne používa na detekciu DNA už 20-30 rokov. PCR testy sa používajú priamo na detekciu antigénu detekciou vírusovej RNA. Vo všeobecnosti je vírusová RNA prítomná v tele pred detekciou protilátok alebo pred objavením sa symptómov ochorenia. Preto test PCR môže zistiť, či niekto má alebo nemá vírus včas. V súčasnosti je štandardným testom na detekciu COVID-19 PCR. Existujú rôzne typy techník PCR, ako je real-time PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot start PCR a long-range PCR, atď. PCR využíva sériu teplotných zmien na vytvorenie kópií DNA prostredníctvom amplifikácie.
RT-PCR je špeciálna verzia techniky PCR. Používa sa pri detekcii RNA. Teraz sa používa na testovanie COVID-19. RT-PCR je pomerne citlivá a spoľahlivá technika. Pri RT-PCR sa po odbere vzorky použijú chemikálie na odstránenie nežiaducich proteínov, tukov a iných molekúl, pričom zanechá RNA. Enzýmy testovacej súpravy najskôr konvertujú RNA na DNA, ktorá potom amplifikuje vírusovú DNA, aby sa vírus zistil. Fluorescenčné farbivá sa zvyčajne používajú na naviazanie na amplifikovanú DNA a produkciu svetla. Toto môže byť prečítané strojom, aby vytvoril výsledok testu.
Aké sú podobnosti medzi LAMP a testom PCR?
- Sú to techniky zosilnenia.
- Obe produkujú skopírovanú DNA.
- Sú to veľmi citlivé a spoľahlivé techniky ako imunitné techniky, ako je detekcia protilátok.
- Obe sa používajú na testovanie na COVID-19.
Aký je rozdiel medzi LAMP a PCR testom?
Kľúčový rozdiel medzi testami LAMP a PCR je v tom, že pri LAMP sa amplifikácia dosahuje pomocou konštantnej teploty (60-650C), zatiaľ čo pri PCR sa cyklovanie požadované teploty. V súčasnosti je k dispozícii niekoľko typov techník LAMP. Najdôležitejšie pre detekciu COVID-19 sú však izotermická technika sprostredkovaná reverznou transkripčnou slučkou (RT-LAMP) a amplifikácia sprostredkovaná transkriptom (TMA). Okrem toho sú v súčasnosti v klinickej praxi dostupné rôzne typy techník PCR na diagnostiku chorôb, ako je real-time PCR, RT-PCR, nested PCR, multiplex PCR, hot-start PCR, long-range PCR atď.
Nasledujúca infografika uvádza rozdiely medzi testom LAMP a PCR v tabuľkovej forme.
Zhrnutie – LAMP vs test PCR
Izotermálna amplifikácia sprostredkovaná slučkou je podobný proces ako testy PCR, ako je RT-PCR, ale vytvára viac kópií vírusovej DNA pri konštantnej teplote. Test polymerázovej reťazovej reakcie je v súčasnosti najbežnejšou a štandardnou formou testovania na svete na diagnostiku chorôb, ako je diagnostika COVID-19. Považuje sa za pomerne spoľahlivé. PCR využíva sériu teplotných zmien na vytvorenie kópií DNA prostredníctvom amplifikácie. Toto sumarizuje rozdiel medzi testom LAMP a testom PCR.
