Kľúčový rozdiel – opakujúca sa DNA verzus satelitná DNA
Genomická DNA sa skladá hlavne z kódujúcej DNA a nekódujúcej DNA. Kódujúce sekvencie sú známe ako gény. Na chromozómoch sa nachádzajú tisíce génov. Repetitívna DNA, intróny a regulačné sekvencie sa v genóme považujú za nekódujúcu DNA. Repetitívna DNA sú nukleotidové sekvencie opakujúce sa znova a znova v genóme organizmov. Repetitívna DNA predstavuje významnú časť genómovej DNA a je kategorizovaná do troch hlavných typov nazývaných tandemové opakovania, terminálne opakovania a rozptýlené opakovania. Tandemové opakovania sa v genóme veľmi opakujú. Jedným typom tandemových opakovaní je satelitná DNA. Kľúčový rozdiel medzi repetitívnou DNA a satelitnou DNA je ten, že repetitívna DNA sú opakované sekvencie DNA v genóme, zatiaľ čo satelitná DNA je typ repetitívnej DNA, ktorá sa vysoko opakuje a nachádza sa väčšinou v heterochromatickej oblasti okolo centroméry.
Čo je repetitívna DNA?
Opakujúca sa DNA má opakované nukleotidové sekvencie znova a znova. Repetitívna DNA je tiež známa ako opakujúce sa prvky alebo opakovania. Repetitívna DNA zaberá významnú časť celkového genómu mnohých organizmov. Ľudský genóm obsahuje viac ako dve tretiny sekvencie opakujúcej sa DNA. Tieto nekódujú proteíny a patria do kategórie nekódujúcej DNA genómu.
Existujú tri hlavné typy opakujúcich sa DNA, ktoré sa nazývajú terminálne opakovania, tandemové opakovania a rozptýlené opakovania. Tandemové opakovania sú vysoko opakované sekvencie, ktoré ležia vedľa seba. Existujú tri typy tandemových opakovaní nazývaných satelitná DNA, minisatelitná DNA a mikrosatelitná DNA. Roztrúsená repetitívna DNA je opakujúca sa sekvencia rozptýlená po celom genóme ako jednotlivé jednotky s jedinečnými ohraničujúcimi sekvenciami. Existujú dva typy rozptýlenej DNA nazývané transpozóny a retrotranspozóny. Vznikajú vďaka schopnosti transpozície v rámci genómu. Retrotranspozóny patria do triedy 1 transponovateľných prvkov a sledujú mechanizmus kopírovania a vkladania, aby sa integrovali do genómu. Transpozóny patria do triedy 2 transponovateľných prvkov, pretože sa pohybujú pozdĺž genómu pomocou mechanizmu vystrihnutia a vloženia.
Hoci repetitívna DNA nie je kódovaná pre proteíny, sú dôležité pre rôzne funkcie v genóme. Repetitívna DNA je nevyhnutná na formátovanie expresie jedinečných kódujúcich sekvencií a na poskytovanie dodatočných funkcií potrebných na replikáciu genómu a presný prenos do dcérskych buniek atď. Repetitívna DNA tiež poskytuje významnú časť oblastí lešenia alebo pripojenia matrice, čo dokazuje jej nevyhnutnosť pri organizácii genómu organizmov.
Čo je satelitná DNA?
Satelitná DNA je typ opakujúcej sa DNA, ktorá sa vysoko opakuje. Patria do kategórie repetitívnych DNA nazývaných tandemové repetície. Satelitná DNA sa tandemovo opakuje a nachádza sa v oblasti centroméry a teloméry chromozómov. Jedna krátka opakujúca sa jednotka satelitnej DNA má rozsah od 5 do 300 párov báz, v závislosti od druhu. Normálne sa v genóme opakujú 105 až 106 krát. V genóme cicavcov tvorí satelitná DNA 10 – 20 % frakciu.
Satelitná DNA nekóduje proteíny a neprenáša funkčné genetické informácie. Prispievajú k chromozomálnej organizácii, pretože slúžia ako hlavný komponent funkčných centromér a ako hlavná štrukturálna zložka heterochromatínu.
Satelitná DNA sa v hustote líši od väčšiny DNA. Preto poskytuje počas ultracentrifugácie samostatný pás. Existujú rôzne typy satelitnej DNA známe ako alphoidná DNA, beta, satelit 1, satelit 2, satelit 3 atď.
Obrázok 01: Opakovaná DNA a satelitná DNA
Aký je rozdiel medzi repetitívnou DNA a satelitnou DNA?
Opakujúca sa DNA vs satelitná DNA |
|
| Repetitívna DNA sú nukleotidové sekvencie, ktoré sa mnohokrát opakujú v genóme organizmov. | Satelitná DNA je jeden typ opakujúcej sa DNA, ktorá sa v genóme opakuje miliónkrát. |
| Typy | |
| Existujú tri hlavné typy, ako sú koncové opakovania, tandemové opakovania a rozptýlené opakovania. | Satelitná DNA je klasifikovaná do rôznych typov, ako sú alphoid, beta, saterllite1, 2 a 3 atď. |
| Umiestnenie | |
| Opakujúca sa DNA sa nachádza v celom genóme. | Satelitná DNA sa nachádza v centromérových a telomérových oblastiach chromozómu. |
Súhrn – opakujúca sa DNA vs satelitná DNA
Genómy sú usporiadané do rôznych typov DNA. Kódujúce sekvencie medzi nimi sú uložené s genetickou informáciou na syntézu proteínov. Iné nekódujúce sekvencie poskytujú štrukturálne a prídavné funkcie na replikáciu DNA, udržiavanie štruktúry chromozómov atď. Repetitívna DNA je typ nekódujúcej DNA, ktorá sa v genóme znova a znova opakuje. Repetitívna DNA má rôzne typy a satelitná DNA, ktorá sa nachádza v oblasti centroméry a teloméry chromozómov, je jedným z nich. Toto je rozdiel medzi repetitívnou DNA a satelitnou DNA.
Stiahnuť PDF verziu opakujúcej sa DNA vs satelitná DNA
Môžete si stiahnuť PDF verziu tohto článku a použiť ju na offline účely podľa citácií. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi repetitívnou DNA a satelitnou DNA – PDF.
