Kľúčový rozdiel medzi bezbunkovou DNA a cirkulujúcou nádorovou DNA je v tom, že bezbunková DNA sú rôzne formy DNA, ktoré voľne cirkulujú v krvi, zatiaľ čo cirkulujúca nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvodená od nádoru, ktorá cirkuluje v krvi.
Bezbunková DNA a cirkulujúca nádorová DNA sú dva typy cirkulujúcich nukleových kyselín. Cirkulujúce nukleové kyseliny objavili Mandel a Metal v roku 1948. Neskôr sa zistilo, že množstvo cirkulujúcich nukleových kyselín u chorých pacientov je výrazne vysoké. Tento objav bol prvýkrát urobený v súvislosti s pacientmi s lupusom. Okrem toho majú cirkulujúce nukleové kyseliny vyššiu prognostickú hodnotu a možno ich použiť ako biomarker na detekciu rôznych chorôb.
Čo je to bezbunková DNA?
Bezbunková DNA (Cf DNA) označuje rôzne formy DNA, ako je cirkulujúca nádorová DNA, bezbunková mitochondriálna DNA a bezbunková fetálna DNA atď., ktoré voľne cirkulujú v krvi. Zvýšené hladiny bezbunkovej DNA sa pozorujú pri pokročilých ochoreniach, ako je rakovina, trauma, sepsa, infarkt myokardu, cukrovka, mŕtvica, kosáčikovitá anémia atď. Okrem rakoviny a fetálnej medicíny je bezbunková DNA užitočným biomarkerom pre množstvo ochorení. Táto DNA sa môže použiť aj na detekciu odmietnutia transplantovaného štepu. Používajú sa aj pri určovaní bežného stresu, prenatálneho rozlišovania pohlavia a pri testovaní otcovstva.
Obrázok 01: Cell Free DNA
Bezbunková DNA je zvyčajne dvojvláknová extracelulárna molekula DNA. Pozostáva z malých fragmentov (50 až 200 bp) a väčších fragmentov (21 kb). Okrem toho už bol uznaný ako spoľahlivý biomarker na diagnostiku rakoviny prostaty a prsníka. Bezbunková DNA cirkuluje prevažne v krvnom obehu ako nukleozómy. Nukleozómy sú jadrové komplexy histónov a DNA. Cf DNA možno kvantifikovať pomocou rôznych techník, ako je PCR, masívne paralelné sekvenovanie, ultrafialová spektrometria, farbenie PicoGreen a ELISA. Keďže detekcia Cf DNA v krvnom riečisku je rýchla, jednoduchá, neinvazívna, opakujúca sa metóda, v budúcnosti bude potenciálnym biomarkerom na diagnostiku mnohých chorôb, ako sú autoimunitné reumatické choroby a nádory.
Čo je DNA cirkulujúceho nádoru?
Cirkulujúca nádorová DNA (Ct DNA) je fragmentovaná DNA odvodená od nádoru, ktorá cirkuluje v krvi. Má nádorový pôvod. Keďže cirkulujúci nádor môže odrážať celý genóm nádoru, získal veľkú príťažlivosť pre svoje potenciálne využitie v klinických zostavách. Tekuté biopsie, ktoré odoberajú krv, sa môžu použiť na testovanie cirkulujúcich nádorov.
Obrázok 02: Cirkulujúca nádorová DNA
Biologické procesy, ktoré sa pravdepodobne podieľajú na uvoľňovaní Ct DNA, zahŕňajú apoptózu a nekrózu z umierajúcich buniek alebo aktívne uvoľňovanie z nádorových buniek. V zdravých tkanivách môžu infiltrujúce fagocyty vyčistiť Ct DNA. Okrem toho je možné pri analýze cirkulujúcej nádorovej DNA použiť rôzne techniky, ako je kvapôčková digitálna PCR, BEAMing, CAPP-Seq (hlboké sekvenovanie), bezpečné sekvenovanie a duplexné sekvenovanie.
Aké sú podobnosti medzi bezbunkovou DNA a DNA cirkulujúceho nádoru?
- Bezbunková DNA a cirkulujúca nádorová DNA sú dva typy cirkulujúcich nukleových kyselín.
- Sú tvorené nukleotidmi.
- Oba typy možno použiť ako potenciálne markery na diagnostiku rôznych chorôb v klinických zariadeniach.
- Nachádzajú sa v krvnom obehu.
- Obe sú extracelulárne formy molekúl DNA.
- Obaja sú vyčistené infiltráciou fagocytov.
Aký je rozdiel medzi bezbunkovou DNA a DNA cirkulujúceho nádoru?
Bezbunková DNA sú rôzne formy DNA, ako napríklad cirkulujúca nádorová DNA, bezbunková mitochondriálna DNA a bezbunková fetálna DNA atď., ktoré voľne cirkulujú v krvi, zatiaľ čo cirkulujúca nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvodená z nádoru ktorý cirkuluje v krvi. Toto je kľúčový rozdiel medzi bezbunkovou DNA a cirkulujúcou nádorovou DNA. Okrem toho bezbunková DNA cirkuluje vo fragmentoch v rozsahu od 50 do 220 bp, zatiaľ čo cirkulujúca nádorová DNA cirkuluje vo fragmentoch v rozsahu od 134 do 144 bp.
Nasledujúca infografika predstavuje rozdiel medzi bezbunkovou DNA a cirkulujúcou nádorovou DNA v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – Bezbunková DNA verzus DNA cirkulujúceho nádoru
Cirkulujúce nukleové kyseliny sa vrhajú do krvného obehu prostredníctvom regulovaných alebo náhodných mechanizmov. Bezbunková DNA a cirkulujúca nádorová DNA sú dva typy cirkulujúcich nukleových kyselín. Bezbunková DNA sú rôzne formy DNA, ako je cirkulujúca nádorová DNA, bezbunková mitochondriálna DNA, bezbunková fetálna DNA, ktoré voľne cirkulujú v krvi, zatiaľ čo cirkulujúca nádorová DNA je fragmentovaná DNA odvodená od nádoru, ktorá cirkuluje v krvi. Toto sumarizuje rozdiel medzi bezbunkovou DNA a cirkulujúcou nádorovou DNA.
