Kľúčový rozdiel medzi T4 DNA ligázou a E. coli DNA ligázou je v tom, že T4 DNA ligáza je enzým, ktorý je izolovaný z bakteriofága T4, zatiaľ čo DNA ligáza E. coli je enzým, ktorý je izolovaný z baktérie E. coli.
DNA ligáza je špecifický typ enzýmu, ktorý uľahčuje spájanie reťazcov DNA prostredníctvom tvorby fosfodiesterovej väzby. Hrá dôležitú úlohu pri oprave jednovláknových zlomov a dvojvláknových zlomov v DNA živých organizmov. Okrem toho sa DNA ligáza používa pri oprave DNA aj replikácii DNA. Okrem vyššie uvedených použití má DNA ligáza tiež rozsiahle využitie v experimentoch molekulárnej biológie, ako je napríklad technológia rekombinantnej DNA. T4 DNA ligáza a E. coli DNA ligáza sú dva typy enzýmov DNA ligázy.
Čo je T4 DNA ligáza?
T4 ligáza je enzým spájajúci DNA, ktorý je izolovaný z bakteriofága T4. Bakteriofág T4 je vírus, ktorý infikuje Escherichia coli. Enzým T4 ligáza je najbežnejšie používaná DNA ligáza v molekulárno-biologickom laboratórnom výskume. Normálne T4 ligáza katalyzuje spojenie dvoch kohéznych alebo tupo zakončených reťazcov dvojvláknovej DNA medzi 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými skupinami susedných nukleotidov. Môže tiež katalyzovať spojenie RNA s reťazcom DNA alebo RNA v duplexnej molekule. Tento enzým však nebude spájať jednovláknové nukleové kyseliny. Okrem toho môže tiež ligovať DNA s tupými koncami s oveľa vyššou účinnosťou ako DNA ligáza E. coli.
Obrázok 01: T4 DNA ligáza
Tento enzým vyžaduje ATP ako kofaktor. Niektoré výskumné experimenty v oblasti genetického inžinierstva už vytvorili aktívnejšie enzýmy DNA ligázy ako T4 DNA ligáza divokého typu. V jednom z prístupov vytvorili molekulu fúzneho enzýmu spojením T4 DNA ligázy buď s molekulou p50 alebo NF-kB. Tento nový enzým T4 ligáza bol o 160 % aktívnejší pri ligáciách s tupými koncami na účely klonovania ako T4 DNA ligáza divokého typu. Okrem toho optimálna teplota pre T4 DNA ligázu na presnejšie katalyzovanie ligačnej reakcie je 16 °C.
Čo je E Coli DNA ligáza?
E. coli DNA ligáza je enzým, ktorý je izolovaný z baktérií E. coli. Gén zodpovedný za tvorbu E. coli DNA ligázy je gén lig. DNA E. coli, ligáza, ako aj väčšina prokaryotných DNA ligáz využívajú energiu získanú NAD (nikotínamid adenín dinukleotid) na vytvorenie fosfodiesterovej väzby.
Obrázok 02: E. Coli DNA ligáza
E. coli DNA ligáza je ligačný enzým, ktorý dokáže spájať fragmenty DNA katalyzovaním tvorby fosfodiesterových väzieb medzi fragmentmi dvojvláknovej DNA obsahujúcimi 5' fosfátové konce a 3' hydroxylové konce. Okrem toho neviaže DNA s tupými koncami, s výnimkou špeciálnych podmienok, ako je molekulárne prekrytie polyetylénglykolom. Tiež nedokáže efektívne spojiť RNA s DNA. Okrem toho, aktivita E. coli DNA ligázy môže byť zvýšená prítomnosťou DNA polymerázy 1 v správnej koncentrácii. Ak je však koncentrácia enzýmu DNA polymerázy 1 vyššia, má to nepriaznivé účinky na aktivitu DNA ligázy E. coli.
Aké sú podobnosti medzi T4 DNA ligázou a E Coli DNA ligázou?
- T4 DNA ligáza a E-coli DNA ligáza sú dva typy enzýmov DNA ligázy.
- Obaja sú bielkoviny zložené z aminokyselín.
- Tieto enzýmy katalyzujú tvorbu fosfodiesterovej väzby medzi 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými koncami vedľa seba v duplexnej DNA.
- Majú rozsiahle využitie v experimentoch molekulárnej biológie, ako je napríklad technológia rekombinantnej DNA.
Aký je rozdiel medzi T4 DNA ligázou a E Coli DNA ligázou?
T4 DNA ligáza je enzým, ktorý sa izoluje z bakteriofága T4, zatiaľ čo DNA ligáza E. coli je enzým, ktorý sa izoluje z baktérií E. coli. Toto je kľúčový rozdiel medzi T4 DNA ligázou a E. coli DNA ligázou. Okrem toho je zdrojom energie pre T4 DNA ligázu ATP. Na druhej strane zdrojom energie pre DNA ligázu E. coli je NAD.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi T4 DNA ligázou a E coli DNA ligázou v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – T4 DNA ligáza verzus E Coli DNA ligáza
T4 DNA ligáza a E. coli DNA ligáza sú dva enzýmy, ktoré katalyzujú tvorbu fosfodiesterovej väzby medzi vedľa seba umiestnenými 5' fosfátovými a 3' hydroxylovými koncami v duplexnej DNA. T4 ligáza je enzým, ktorý je izolovaný z bakteriofágu T4, zatiaľ čo DNA ligáza E. coli je enzým, ktorý je izolovaný z baktérií E. coli. Toto je kľúčový rozdiel medzi T4 DNA ligázou a E coli DNA ligázou.
