Kľúčový rozdiel medzi sigma faktorom a rho faktorom je ten, že sigma faktor je proteín potrebný na spustenie transkripcie v baktériách, zatiaľ čo rho faktor je proteín potrebný na ukončenie transkripcie v baktériách.
Sigma faktor a rho faktor sú dva dôležité faktory pre bakteriálnu transkripciu. Bakteriálna transkripcia je proces, pri ktorom sa časť bakteriálnej DNA skopíruje do novo vytvoreného vlákna mRNA (messenger RNA). Tento proces je katalyzovaný enzýmom známym ako RNA polymeráza. Baktérie sa vo veľkej miere spoliehajú na transkripciu a preklad, aby správne reagovali na svoje prostredie. Bakteriálna RNA polymeráza pozostáva z jadra a štruktúry holoenzýmu. Jadro obsahuje podjednotky β, β′, α a 2ω, zatiaľ čo holoenzým obsahuje faktor sigma. Okrem toho je pre bakteriálnu transkripciu veľmi dôležitý aj vedľajší faktor RNA polymerázy známy ako rho faktor.
Čo je Sigma Factor?
Sigma faktor alebo faktor špecifickosti je proteín potrebný na spustenie transkripcie v baktériách. Je to bakteriálny faktor iniciácie transkripcie. Tento faktor umožňuje počas transkripcie väzbu enzýmu RNA polymerázy na špecifickú oblasť DNA nazývanú promótorová oblasť. Sigma faktor je normálne homológny s archaálnym transkripčným faktorom B a s eukaryotickým transkripčným faktorom TF11B. Okrem toho sa špecifický sigma faktor daného génu mení v závislosti od génu a signálov prostredia. Promótory sú vybrané RNA polymerázou v závislosti od sigma faktora, ktorý je s ňou spojený.
Obrázok 01: Sigma Factor
Faktor sigma možno nájsť aj v chloroplastoch rastlín ako súčasť plastidom kódovanej polymerázy (PEP). Faktor sigma a RNA polymeráza sú spolu známe ako holoenzým RNA polymerázy. Molekulová hmotnosť sigma faktora je okolo 70 kDa. Po iniciácii transkripcie sa sigma faktor oddelí od komplexu. Potom RNA polymeráza pokračuje v predlžovaní, kým sa neskončí transkripcia.
Čo je to Rho faktor?
Rho faktor je prokaryotický proteín, ktorý sa podieľa na ukončení transkripcie. Rho faktor sa zvyčajne viaže na miesto pauzy terminátora transkripcie. Toto miesto je exponovaná oblasť jednovláknovej RNA v blízkosti otvoreného čítacieho rámca v sekvenciách bohatých na guanín bohatých na cytozín. Je to nevyhnutný transkripčný proteín v prokaryotoch. V Escherichia coli je rho faktor približne 274,6 kDa hexamér identických podjednotiek. Každá podjednotka má doménu viažucu RNA a doménu hydrolýzy ATP. Funkciou rho faktora je navyše helikázová aktivita.
Obrázok 02: Rho faktor
Rho faktor sa viaže na molekulu RNA a potom využíva svoju aktivitu ATPázy na poskytnutie energie na translokáciu molekúl RNA. Rho faktor vykonáva translokáciu, kým nedosiahne špirálovitú oblasť RNA-DNA, kde rozvinie hybridnú (RNA-DNA) duplexnú štruktúru. Tento proces pozastaví RNA polymerázu v mieste ukončenia a ukončí proces transkripcie.
Aké sú podobnosti medzi sigma faktorom a Rho faktorom?
- Sigma faktor a rho faktor sú dva dôležité faktory pre bakteriálnu transkripciu.
- Obaja sú prítomné iba v prokaryotoch.
- Sú to bielkoviny zložené z aminokyselín.
- Obaja sú proteíny viažuce nukleové kyseliny.
- Prokaryoty sa vo veľkej miere spoliehajú na tieto faktory pri vytváraní mRNA, ktorá dokáže vytvoriť zvláštne proteíny a pomôcť im špecificky reagovať na ich prostredie.
Aký je rozdiel medzi sigma faktorom a Rho faktorom?
Sigma faktor je proteín potrebný na iniciáciu transkripcie v baktériách, kým rho faktor je proteín potrebný na ukončenie transkripcie v baktériách. Toto je kľúčový rozdiel medzi faktorom sigma a faktorom rho. Okrem toho sigma faktor je proteín viažuci DNA, zatiaľ čo faktor rho je proteín viažuci RNA.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi faktorom sigma a faktorom rho v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Summary – Sigma Factor vs Rho Factor
Trankripcia je proces, pri ktorom sa informácie v DNA skopírujú do novej molekuly nazývanej mRNA (messenger RNA). Táto m-RNA sa nakoniec podieľa na produkcii špecifického proteínu. Sigma faktor a rho faktor sú dva dôležité faktory pre bakteriálnu transkripciu. Sú to bielkoviny. Sigma faktor sa podieľa na iniciácii transkripcie v baktériách. Rho faktor je zodpovedný za ukončenie transkripcie v baktériách. Toto je zhrnutie rozdielu medzi sigma faktorom a rho faktorom.
