Kľúčový rozdiel – minisatelit vs mikrosatelit
Repetitívna DNA sú nukleotidové sekvencie opakujúce sa znova a znova v genóme organizmov. Repetitívna DNA predstavuje významnú časť genómovej DNA a existujú tri hlavné typy nazývané tandemové opakovania, terminálne opakovania a rozptýlené opakovania. Tandemové opakovania sú vysoko opakované sekvencie, ktoré ležia vedľa seba bez prerušenia. V genóme stavovcov existujú tri hlavné typy tandemových opakovaní. Sú to satelitná DNA, mikrosatelitná DNA a minisatelitná DNA. Minisatelit je úsek vysoko opakovanej DNA, ktorý pozostáva zo série opakujúcich sa sekvencií zložených z 10 až 100 párov báz. Mikrosatelit je úsek repetitívnej DNA, ktorý pozostáva z krátkych opakujúcich sa sekvencií zložených z 1 až 9 párov báz. Preto je kľúčovým rozdielom medzi minisatelitom a mikrosatelitom veľkosť alebo dĺžka opakujúcej sa sekvencie.
Čo je minisatelit?
Minisatelitná DNA je úsek DNA, ktorý obsahuje sériu krátkych opakujúcich sa sekvencií DNA s dĺžkou 10 až 60 párov báz. Minisatelity sa tiež označujú ako tandemové opakovania s premenlivým počtom (VNTR). Minisatelity sa často zamieňajú s mikrosatelitmi. Vedci však teraz rozlišujú minisatelity a mikrosatelity na základe veľkosti opakujúcej sa sekvencie.
Minisatelity možno vidieť na viac ako 1000 miestach v ľudskom genóme. Tieto krátke sekvencie sú bohaté na G a C. Počet opakovaní v danom minisatelite sa medzi jednotlivcami značne líši.
Prvý ľudský minisatelit identifikovali A. R. Wyman a R. White v roku 1980. Neskôr Alec Jeffreys objavil extrémny polymorfizmus počtu kópií minisatelitov medzi organizmami. Tieto objavy urobili minisatelity ako ideálne markery pre DNA fingerprinting, analýzu väzieb a populačné štúdie. Minisatelity tiež prispievajú k regulácii génovej expresie, transkripcie, alternatívneho zostrihu atď.
Čo je mikrosatelit?
Mikrosatelit je úsek DNA, ktorý má jednoduché sekvenčné opakovania s dĺžkou 1 až 10 párov báz. Mikrosatelity sa tiež nazývajú krátke sekvencie opakovania (SSR) alebo jednoduché tandemové opakovania (STR). Existujú dva typy mikrosatelitov, ktoré sa nazývajú jednoduché mikrosatelity a zložené mikrosatelity. Jednoduché mikrosatelity pozostávajú iba z jedného typu opakujúcich sa sekvencií. Kompozitné mikrosatelity pozostávajú z viac ako jedného typu opakovaní. Mikrosatelity majú najčastejšie poly A/T oblasti. Mikrosatelity sú kodominantné a hojné v eukaryotických genómoch.
Podobne ako minisatelity, aj mikrosatelity vykazujú polymorfizmus medzi jednotlivcami. Počet opakovaní pre daný mikrosatelit sa medzi jednotlivcami líši. Preto sa mikrosatelity môžu použiť aj ako genetické markery pri odtlačkoch DNA. Polymorfizmus mikrosatelitov možno ľahko identifikovať pomocou PCR a gélovej elektroforézy. Okrajová oblasť mikrosatelitu je u príbuzných druhov vysoko zachovaná.
Aké sú podobnosti medzi minisatelitom a mikrosatelitom?
- Minisatelity a mikrosatelity sú nekódujúce sekvencie DNA.
- Obe sú tandemové opakovania.
- Obe pozostávajú z vysoko sa opakujúcich sekvencií.
- Obidva môžu byť použité ako výkonné genetické markery pre DNA fingerprinting.
Aký je rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom?
Minisatelit vs mikrosatelit |
|
| Minisatelity sú tandemové opakovania s dĺžkou opakovania monoméru 10 až 100 párov báz. | Mikrosatelity sú krátke tandemové opakovania, ktoré pozostávajú z 1 až 9 párov báz monomérnych opakujúcich sa sekvencií. |
| Veľkosť opakujúcej sa sekvencie | |
| Minisatelit má opakujúce sa sekvencie 10 až 100 párov báz. | Mikrosatelit má krátke sekvencie 1 až 9 párov báz. |
| Spoločné základy | |
| Minisatelity sú bohaté na G a C bázy. | Mikrosatelity sú bohaté na bázy A a T. |
| Iné mená | |
| Minisatelity sú známe aj ako tandemové opakovania s premenlivým počtom (VNTR). | Mikrosatelity sú známe aj ako krátke sekvencie opakovania (SSR) alebo jednoduché tandemové opakovania (STR). |
Zhrnutie – minisatelit vs mikrosatelit
Minisatelit a mikrosatelit sú dva typy tandemových opakovaní. Rozlišujú sa na základe počtu báz v opakujúcej sa sekvencii alebo veľkosti sekvencie. Minisatelit má opakujúcu sa sekvenciu s dĺžkou 10 až 100 párov báz, zatiaľ čo mikrosatelit má opakujúcu sa sekvenciu s dĺžkou 1 až 9 párov báz. Toto je hlavný rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom. Počet kópií opakujúcej sa sekvencie v minisatelitoch a mikrosatelitoch sa medzi jednotlivcami značne líši. Minisatelity aj mikrosatelity sú silné DNA markery na analýzu genetických variácií v rámci populácií druhov a medzi nimi.
Stiahnuť PDF verziu Minisatellite vs Microsatellite
Môžete si stiahnuť PDF verziu tohto článku a použiť ju na offline účely podľa citácií. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi minisatelitom a mikrosatelitom.
