Kľúčový rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom je v tom, že aktívne miesto napomáha katalýze chemickej reakcie, zatiaľ čo väzbové miesto pomáha pri väzbe ligandu na veľkú molekulu.
Väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môže viazať ligand. Enzýmy sú bielkoviny. Aktívne miesto je oblasť enzýmu, na ktorú sa môžu viazať substráty, aby prešli chemickou reakciou. Táto špecifická oblasť má tiež väzbové miesto spolu s katalytickým miestom. Preto väzbové miesta pomáhajú iba pri väzbe ligandu na veľkú molekulu, zatiaľ čo aktívne miesta napomáhajú väzbe ligandu na veľkú molekulu, pričom ho nechávajú podstúpiť katalyzovanú chemickú reakciu.
Čo je aktívna stránka?
Aktívne miesto je oblasť enzýmu, na ktorú sa viažu substráty chemickej reakcie, aby prešli katalyzovanou chemickou reakciou. táto oblasť pozostáva z dvoch podoblastí ako väzbového miesta a katalytického miesta. Väzbové miesto obsahuje niektoré zvyšky, ktoré môžu pomôcť naviazaniu substrátu (reaktantov) na enzým. Katalytické miesto pomáha pri katalýze chemickej reakcie. Okrem toho je táto oblasť veľmi malá v porovnaní s celým objemom enzýmu; približne 10-20 % celkového objemu enzýmu.
Obrázok 01: Väzbové miesto a katalytické miesto aktívneho miesta
Aktívne miesto zvyčajne obsahuje 3-4 aminokyseliny. zvyšok aminokyselín v enzýme sa podieľa na udržiavaní terciárnej štruktúry enzýmu. Ešte dôležitejšie je, že aktívne miesto má špecifický dizajn, ktorý sa hodí k špecifickému substrátu. Preto tieto enzýmy reagujú len s konkrétnymi substrátmi. Niekedy však enzýmy potrebujú pre svoju funkciu kofaktory. Hlavnou funkciou aktívneho miesta je znížiť aktivačnú energiu chemickej reakcie, a tým zvýšiť rýchlosť reakcie.
Čo je to viazaná stránka?
Väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môžu viazať ligandy. Tam môže ligand vytvoriť chemickú väzbu s týmto miestom. Tieto oblasti vykazujú špecifickosť; konkrétny ligand sa bude viazať na konkrétne väzbové miesto. Preto je toto miesto mierou typov ligandov, ktoré sa môžu viazať s molekulou.
Navyše tieto oblasti často používame na funkčnú charakterizáciu biomolekúl. Funkčnosť aktívneho miesta môžeme napríklad charakterizovať prostredníctvom jeho väzbového miesta. Navyše v prípade DNA je špecifickým typom väzbového miesta väzbové miesto transkripčného faktora prítomné na DNA.
Aký je rozdiel medzi aktívnou stránkou a viazanou stránkou?
Aktívne miesto je oblasť na enzýme, na ktorú sa viažu substráty chemickej reakcie, aby prešli katalyzovanou chemickou reakciou, zatiaľ čo väzbové miesto je oblasť na proteíne, DNA alebo RNA, na ktorú sa môžu viazať ligandy. Toto je kľúčový rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom. Okrem toho sú aktívne miesta prítomné na enzýmoch a pomáhajú zvýšiť reakčnú rýchlosť konkrétnej chemickej reakcie prostredníctvom zníženia aktivačnej energetickej bariéry tejto reakcie. Väzbové miesta sú na druhej strane zodpovedné za väzbu špecifického ligandu s konkrétnou molekulou.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom vo forme tabuľky.
Súhrn – Aktívna stránka verzus záväzná stránka
Aktívne miesta sú oblasti enzýmov, ktoré môžu zvýšiť reakčnú rýchlosť chemickej reakcie znížením aktivačnej energetickej bariéry tejto reakcie. Väzbové miesto je akákoľvek oblasť, na ktorú sa môže viazať ligand. Aktívne miesto obsahuje aj väzbové miesto. Rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovými miestami spočíva v existencii a funkčnosti. Preto je kľúčový rozdiel medzi aktívnym miestom a väzbovým miestom v tom, že aktívne miesto napomáha katalýze chemickej reakcie, zatiaľ čo väzbové miesto pomáha pri väzbe ligandu na veľkú molekulu.
