Kľúčový rozdiel medzi reštrikčnými enzýmami EcoRI a HindIII je v tom, že EcoRI je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z E. coli, zatiaľ čo HindIII je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z Haemophilus influenza.
Reštrikčný enzým alebo reštrikčná endonukleáza je enzým, ktorý štiepi DNA na fragmenty na špecifických rozpoznávacích miestach (reštrikčných miestach) v molekule DNA. Tieto reštrikčné enzýmy sa nachádzajú v baktériách a archeách. Poskytujú obranný mechanizmus proti napadnutiu vírusmi. Reštrikčné enzýmy sú vo všeobecnosti klasifikované do piatich rôznych typov: typ I, typ II, typ III, IV a typ V. EcoRI a HindIII sú dva reštrikčné enzýmy, ktoré patria do skupiny reštrikčných enzýmov typu II.
Čo sú to reštrikčné enzýmy EcoRI?
EcoRI je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov E.coli. Je to reštrikčný enzým, ktorý štiepi dvojité závitnice DNA na fragmenty na špecifických miestach. EcoRI je tiež súčasťou systému reštrikčnej modifikácie. EcoRI bol prvý enzým, ktorý bol pôvodne izolovaný z kmeňa RY13 druhu E. coli. Používa sa ako reštrikčný enzým v molekulárnej biológii. EcoRI vytvára 4 nukleotidové lepkavé konce s 5' koncovými prevismi AATT. EcoRI štiepi DNA v špecifickej rozpoznávacej sekvencii G↓AATTC. Má palindromickú komplementárnu sekvenciu CTTAA↓G. Okrem toho tento reštrikčný enzým patrí do podtriedy typu II P (palindromická špecifickosť). Vo svojej primárnej štruktúre obsahuje EcoRI motív PD. D/EXK vo svojom aktívnom mieste, podobne ako mnohé iné reštrikčné enzýmy.
Obrázok 01: EcoRI
Reštrikčný enzým EcoRI je homodimér s molekulovou hmotnosťou 31 kDa. Obsahuje jednu globulárnu doménu architektúry α/β. Každá podjednotka obsahuje slučku, ktorá vyčnieva z globulárnej domény a po naviazaní sa ovinie okolo DNA. Tento enzým môže byť kokryštalizovaný so sekvenciou, ktorú normálne štiepi. Okrem toho sa reštrikčný enzým EcoRI používa v širokej škále molekulárno-genetických techník, vrátane klonovania, skríningu DNA a deléčných sekcií DNA v podmienkach in vitro.
Čo sú to reštrikčné enzýmy HindIII?
HindIII je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov Haemophilus influenza. Štiepi palindromickú sekvenciu DNA AACCTT v prítomnosti kofaktora Mg2+ prostredníctvom hydrolýzy. Štiepenie tejto konkrétnej sekvencie medzi AA'S (5'A↓ACCTT3' a 3'TTCGA↓A5') má za následok 5' previsy na molekule DNA nazývané lepkavé konce. Tento enzým sa nachádza v prokaryotických organizmoch, ako sú baktérie. Baktérie používajú tento enzým ako obranný mechanizmus proti vírusom, ako sú bakteriofágy.
Obrázok 02: HindIII
Štrukturálne je HindIII homodimér. Obsahuje spoločné štrukturálne jadro obsahujúce štyri β listy a jeden α helix, ako iné typy II reštrikčných enzýmov. Molekulová hmotnosť tohto enzýmu je 34,9 kDa. Okrem toho je HindIII veľmi užitočný v moderných experimentoch molekulárnej biológie, ako je sekvenovanie a mapovanie DNA.
Aké sú podobnosti medzi reštrikčnými enzýmami EcoRI a HindIII?
- EcoRI a HindIII sú dva reštrikčné enzýmy patriace do skupiny reštrikčných enzýmov typu II.
- EcoRI a HindIII boli nájdené začiatkom 70. rokov.
- EcoRI aj HindIII obsahujú motív aminokyselinovej sekvencie PD.. D/EXK.
- Oba reštrikčné enzýmy vykonávajú veľmi špecifické štiepenie DNA.
- Tieto reštrikčné enzýmy potrebujú Mg2+ ako kofaktor pre svoju špecifickú aktivitu.
- Po rozrezaní DNA vytvárajú lepkavé konce.
- Sú to veľmi užitočné komponenty v modernom molekulárno-biologickom výskume.
Aký je rozdiel medzi reštrikčnými enzýmami EcoRI a HindIII?
EcoRI je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov E.coli, zatiaľ čo HindIII je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov Haemophilus influenza. Toto je kľúčový rozdiel medzi EcoRI a HindIII. Okrem toho EcoRI štiepi DNA v špecifickej rozpoznávacej sekvencii G↓AATTC, zatiaľ čo HindIII štiepi DNA v špecifickej rozpoznávacej sekvencii A↓ACCTT.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi EcoRI a HindIII v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Summary – EcoRI vs HindIII Restriction Enzymes
EcoRI a HindIII sú dva reštrikčné enzýmy, ktoré patria do podtriedy p typu II. Vykonávajú veľmi špecifické štiepenie DNA. EcoRI je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov E. coli, zatiaľ čo HindIII je reštrikčný enzým typu II, ktorý je izolovaný z druhov Haemophilus influenza. Toto sumarizuje rozdiel medzi EcoRI a HindIII.
