Kľúčový rozdiel medzi inzerčnými a náhradnými vektormi je v tom, že inzerčný vektor má schopnosť vložiť cudziu DNA strednej dĺžky, zatiaľ čo náhradný vektor má schopnosť prispôsobiť sa väčšej dĺžke cudzej DNA.
Fágové vektory sú bakteriofágy používané na klonovanie. Existujú dva typy fágových vektorov; sú to inzerčný vektor a náhradný vektor. Všetky fágové vektory tiež pozostávajú z neesenciálnych génov. Tieto gény však musia byť z fágov odstránené, aby sa uľahčili nové inzerty cudzej DNA.
Čo je to vložený vektor?
V prvom rade je inzerčný vektor najjednoduchšou formou lambda klonovacích vektorov. V skutočnosti je to typ fágového vektora, ktorý má jedinečné reštrikčné miesto zavedené do vektorového genómu v polohe voliteľnej DNA. Okrem toho fágová DNA zostáva bez odstránenia. Toto neodstránenie fágovej DNA zmenšuje veľkosť inzertov (cudzej DNA), ktoré sa majú klonovať vo vektore. Okrem toho sú tieto vektory užitočné pri klonovaní a expresii cDNA. GT10, GT11 a Zap sú príklady tohto vektora.
Obrázok 01: Lambda Phage
Vektor vloženia pozostáva z jedného rozpoznávacieho miesta. Primárnou funkciou tohto vektora je vyvinúť cDNA knižnice odvodené z eukaryotických mRNA sekvencií. Okrem toho môže pojať iba dĺžky cudzej DNA v rozmedzí 05 až 11 kb. Má tiež jedinečné miesto štiepenia na vloženie cudzej DNA.
Čo sú náhradné vektory?
Náhradný vektor alebo substitučný vektor je typ fágového vektora vyvinutý odstránením strednej oblasti „výplňového fragmentu“fágovej DNA. Požadovaný inzert cudzej DNA nahrádza fágovú DNA.
Obrázok 02: Náhradný vektor
Náhradné vektory sú dôležité pri vytváraní genómových knižníc, ako sú EMBL4 a Charon40. Tieto vektory môžu pojať väčšiu dĺžku cudzej DNA v rozmedzí dĺžok 08-24 kb. Výplňová oblasť tiež pozostáva z génu, ktorý robí fágový vektor neživotaschopným vo vnútri bakteriálneho hostiteľa.
Aké sú podobnosti medzi vkladacími a náhradnými vektormi?
- Vektory vkladania a nahradzovania sú fágové vektory.
- Oba vektory obsahujú cudzie DNA inzerty.
- Obaja sú nápomocní pri vytváraní DNA knižníc.
Aký je rozdiel medzi vkladacími a náhradnými vektormi?
Vloženie vs náhradné vektory |
|
Inzerčný vektor je typ fágového vektora, ktorý má reštrikčné miesto zavedené do fágového genómu na miesto voliteľnej DNA. | Náhradný vektor je typ fágového vektora vyvinutý odstránením strednej oblasti „výplňového fragmentu“fágovej DNA |
Veľkosť vložených fragmentov | |
05-11 kb dĺžka | 08-24 kb dĺžka |
Fragment výplne | |
Žiadny fragment výplne | Fragment výplne sa nahradí cudzou vložkou |
Funkcia | |
Dôležité na vytvorenie cDNA knižníc | Dôležité pri vytváraní genómových knižníc |
Príklady | |
GT10, GT11 a Zap sú príklady | EMBL4 a Charon40 sú príklady |
Cleavage Site | |
Je prítomná jedinečná stránka štiepenia | Miesto štiepenia obsahuje gény, ktoré nie sú nevyhnutné pre lytický cyklus |
Súhrn – vkladanie verzus náhradné vektory
Inzerčné aj náhradné vektory sú dva typy fágových vektorov. Oba vektory majú reštrikčné miesta, ktoré uľahčujú umiestnenie nových cudzorodých DNA inzertov. Inzerčné vektory sú dôležité pri vytváraní knižníc cDNA, zatiaľ čo náhradné vektory sú dôležité pri vytváraní genómových knižníc. Okrem toho inzerčné vektory obsahujú inzerty DNA so strednou dĺžkou. Ale náhradné vektory môžu pojať väčšie dĺžky cudzorodých DNA inzertov. Celkovo je toto kľúčový rozdiel medzi vektormi vkladania a nahradzovania.