Kľúčový rozdiel medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou závisí od metódy použitej pri vývoji fylogenetického stromu. Maximálna šetrnosť sa zameriava na minimalizáciu celkových stavov charakteru počas konštrukcie fylogenetického stromu, zatiaľ čo maximálna pravdepodobnosť je štatistický prístup pri kreslení fylogenetického stromu v závislosti od pravdepodobnosti medzi genetickými údajmi.
Fylogenéza je nový prístup ku klasifikácii a nomenklatúre organizmov. Fylogenéza sa opiera o genetické údaje a evolučné vzťahy. Genetické údaje sú výsledkom sekvenovania DNA. Vo fylogenéze sa klasifikácia organizmov uskutočňuje na základe spoločného predka. Maximálna šetrnosť a maximálna pravdepodobnosť fylogenetického vzťahu zvyšujú presnosť a spoľahlivosť fylogenetického stromu.
Čo je maximálna šetrnosť?
V technike maximálnej šetrnosti sa minimalizácia celkových zmien stavu charakteru uskutočňuje počas fylogenetickej analýzy. Fylogenetika je odvetvie biológie, ktoré sa zaoberá štúdiom evolučných vzťahov. Fylogenetický strom je strom, ktorý ukazuje evolučné vzťahy založené na spoločnom predkovi. Takže pri kreslení fylogenetického stromu pomocou konceptu maximálnej šetrnosti je množstvo paralelnej evolúcie minimalizované. Preto maximálna šetrnosť vygeneruje strom oveľa rýchlejšie ako iné metódy. Je to preto, že len hlavné rozlišovacie vlastnosti sa berú do úvahy pri maximálnej šetrnosti.
Obrázok 01: Maximálna šetrnosť
Pri kreslení maximálne šetrného stromu je strom vždy najkratší možný strom s minimálnym počtom taxónov. Spoľahlivosť maximálne šetrného stromu je však veľmi vysoká. Štatistická konzistencia a presnosť fylogenetického vzťahu založeného na maximálnej šetrnosti sa budú líšiť. Okrem toho existujú zložité algoritmy, ktoré analyzujú maximálnu šetrnosť fylogenetického vzťahu.
Čo je maximálna pravdepodobnosť?
Maximálna pravdepodobnosť je jednou z najpoužívanejších štatistických metód, ktorá analyzuje fylogenetické vzťahy. Metóda bude analyzovať fylogenézu na základe pravdepodobnostného modelu. Ďalej táto metóda berie do úvahy priemer aj odchýlku. Vo fylogenéze sa teda získa maximálna pravdepodobnosť na základe daných genetických údajov konkrétneho organizmu.
Obrázok 02: Maximálna pravdepodobnosť
Použitie štatistickej metódy maximálnej pravdepodobnosti má výhody aj nevýhody. Metóda je veľmi vhodná pri analýze jednoduchého súboru údajov obsahujúcich genetické informácie. Keď je stupeň rozptylu medzi genetickými údajmi nižší, maximálne skóre pravdepodobnosti je spoľahlivé. Výsledky získané prostredníctvom maximálnej pravdepodobnosti ďalej potvrdzujú maximálne skóre šetrnosti konkrétneho fylogenetického vzťahu. Preto analýza maximálnej pravdepodobnosti funguje ako potvrdzujúci test.
V porovnaní s výhodami uvedenými vyššie je táto metóda pomalý a intenzívny proces. Okrem toho pri absencii jediného súboru údajov je chybový výstup vysoký. Preto tiež sťažuje reprodukovateľnosť výsledkov odhadom maximálnej pravdepodobnosti.
Aké sú podobnosti medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou?
- Maximálna šetrnosť a maximálna pravdepodobnosť sú dva prístupy, ktoré zohrávajú dôležitú úlohu vo fylogenéze.
- Obe techniky zobrazujú vzťah organizmu k jeho predkovi na základe dostupných genetických údajov.
- Fylogenetické stromy možno interpretovať s použitím maximálnej šetrnosti a maximálnej pravdepodobnosti.
- V oboch technikách sa genetické údaje opierajú o sekvenovanie DNA alebo sekvenovanie RNA.
- Obe metódy sú dôležité pri vytváraní fylogenetických stromov.
Aký je rozdiel medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou?
Maximálna šetrnosť aj maximálna pravdepodobnosť sú dva rôzne prístupy pri interpretácii fylogenetického stromu. Maximum šetrnosti verí v analýzu niekoľkých charakteristík a minimalizáciu zmien charakteru od organizmu k organizmu. Na rozdiel od toho metóda maximálnej pravdepodobnosti berie do úvahy strednú hodnotu aj rozptyl a získava maximálnu pravdepodobnosť daných genetických údajov konkrétneho organizmu. Toto je kľúčový rozdiel medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou.
Okrem toho samotná spoľahlivosť maximálnej šetrnosti nie je dostatočná na vyvodenie záveru. Metóda maximálnej pravdepodobnosti však funguje ako potvrdzujúci test výsledkov maximálnej šetrnosti. Preto by sa závery mali robiť s použitím maximálnej šetrnosti a maximálnej pravdepodobnosti.
Nižšie uvedená infografika sumarizuje rozdiel medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou.
Súhrn – maximálna šetrnosť vs. maximálna pravdepodobnosť
Fylogenéza hrá dôležitú úlohu pri odvodzovaní evolučných vzťahov konštrukciou fylogenetických stromov. Maximálna šetrnosť je technika konštrukcie stromu s minimálnym počtom zmien stavu znakov. Na rozdiel od toho maximálna pravdepodobnosť fylogenetického stromu závisí od použitia maximálnej podobnosti medzi genetickými údajmi. Údaje pre obe analýzy pochádzajú z údajov o sekvencii DNA alebo RNA. Spoľahlivosť a presnosť sú vysoké, keď sa stavba stromu uskutočňuje pomocou oboch techník. Toto sumarizuje rozdiel medzi maximálnou šetrnosťou a maximálnou pravdepodobnosťou.
