Kľúčový rozdiel medzi oligopeptidom a polypeptidom je v tom, že oligopeptidy obsahujú málo aminokyselinových zvyškov, zatiaľ čo polypeptidy obsahujú veľké množstvo aminokyselinových zvyškov.
Pojmy oligopeptidy a polypeptidy patria do kategórie proteínov. Peptidy sú krátke reťazce aminokyselín. Aminokyseliny sa navzájom viažu prostredníctvom peptidových väzieb. Preto môžeme tieto peptidy kategorizovať podľa počtu aminokyselín prítomných v týchto peptidoch. Napr. dipeptidy, tripeptidy, tetrapeptidy, oligopeptidy a polypeptidy.
Čo je to oligopeptid?
Oligopeptid je reťazec aminokyselín, ktorý obsahuje malý počet aminokyselín na molekulu. Tieto molekuly často nazývame „peptidy“ako všeobecný pojem. Počet aminokyselinových zvyškov prítomných v týchto peptidových molekulách sa môže pohybovať od dvoch do dvadsiatich aminokyselín. Oligopeptidy môžu zahŕňať aj niektoré malé peptidové formy, ako sú dipeptidy, tripeptidy atď. Niektoré bežné príklady prirodzene sa vyskytujúcich oligopeptidov zahŕňajú mikroviridín, kyanopeptolíny, mikrocystíny atď.
Obrázok 01: Štruktúra tripeptidu
Tieto oligopeptidy sú produkované neribozomálnymi peptidovými syntázami alebo NRPS. Existujú však výnimky. Napríklad cyklamidy a mikroviridín sa syntetizujú prostredníctvom ribozomických dráh. Proces izolácie oligopeptidov zahŕňa obohatenie, čistenie a identifikáciu oligopeptidov. Pre proces identifikácie môžeme použiť gélovú chromatografiu, HPLC, HPLC-hmotnostnú spektroskopiu, iónovo-výmennú chromatografiu atď.
Čo je to polypeptid
Polypeptid je reťazec aminokyselinových zvyškov, ktoré obsahujú veľké množstvo aminokyselín. Proteín obsahuje jeden alebo viac polypeptidových reťazcov. V týchto polypeptidových reťazcoch sú aminokyseliny navzájom spojené prostredníctvom peptidových väzieb, ktoré sú typom kovalentných chemických väzieb. Každý polypeptidový reťazec obsahuje dva terminály: N-terminálny a C-terminálny. N-koniec je amino-koniec, ktorý končí voľnou aminoskupinou, zatiaľ čo C-koniec je karboxy-koniec, ktorý končí voľnou karboxylovou skupinou. Sekvencia aminokyselín prítomných v peptide je určená kodónmi v mRNA, ktoré sa podieľajú na produkcii polypeptidu alebo proteínu prostredníctvom translácie templátového reťazca.
Podľa počtu a usporiadania polypeptidov v proteíne existujú štyri hlavné typy proteínových štruktúr:
- Primárna štruktúra – Primárna štruktúra proteínu obsahuje jeden polypeptidový reťazec, ktorý má disulfidové mostíky medzi niektorými aminokyselinami v rovnakom reťazci, čo vytvára zloženú štruktúru.
- Sekundárna štruktúra – Sekundárna štruktúra proteínu má dve hlavné formy: štruktúru alfa-helixu a štruktúru beta-listu.
Obrázok 02: Štruktúra Alpha Helix
- Terciárna štruktúra – Ide o vysoko poskladanú sieťovú štruktúru. Táto štruktúra je veľmi dôležitá, pretože určuje funkciu proteínu.
- Kvartérna štruktúra – Ide o vysoko zložitú štruktúru dvoch alebo troch polypeptidových reťazcov, ktoré sú navzájom spojené.
Aký je rozdiel medzi oligopeptidom a polypeptidom?
Oligopeptidy a polypeptidy sú dve rôzne kategórie proteínov. Líšia sa od seba v závislosti od počtu aminokyselinových zvyškov prítomných v proteínových molekulách. Preto je kľúčový rozdiel medzi oligopeptidom a polypeptidom v tom, že oligopeptidy obsahujú málo aminokyselinových zvyškov, zatiaľ čo polypeptidy obsahujú veľké množstvo aminokyselinových zvyškov.
Nasledujúca infografika sumarizuje rozdiel medzi oligopeptidom a polypeptidom.
Zhrnutie – Oligopeptid vs. Polypeptid
Oligopeptidy a polypeptidy sú dve rôzne kategórie proteínov. Líšia sa od seba v závislosti od počtu aminokyselinových zvyškov prítomných v týchto proteínových molekulách. To znamená, že kľúčový rozdiel medzi oligopeptidom a polypeptidom je v tom, že oligopeptidy obsahujú málo aminokyselinových zvyškov, zatiaľ čo polypeptidy obsahujú veľké množstvo aminokyselinových zvyškov.
