Kľúčový rozdiel medzi TATA a CAAT boxom je v tom, že TATA box je konzervatívna nukleotidová oblasť, ktorá má konsenzuálnu sekvenciu TATAWAW, zatiaľ čo CAAT box je konzervovaná nukleotidová oblasť s konsenzuálnou sekvenciou GGCCAATCT.
TATA box a CAAT box sú dve oblasti nukleotidov, ktoré ovplyvňujú transkripciu eukaryotických génov. Sú to nekódujúce sekvencie DNA, ktoré sa nachádzajú pred miestom iniciácie transkripcie. V skutočnosti sa nachádzajú v regulačnej oblasti, ktorá je známa ako promótor. TATA box aj CAAT box sú zodpovedné za účinnosť prepisu. Sú to konsenzuálne sekvencie, ktoré sa počas evolučného procesu nezmenili.
Čo je TATA Box?
TATA box alebo Goldberg-Hogness box je konsenzuálna sekvencia nachádzajúca sa v promótorovej oblasti eukaryotických génov. TATA box je základným prvkom promótora. Nachádza sa 25 párov báz proti smeru transkripcie od miesta iniciácie transkripcie. Zachováva sa počas celého evolučného procesu. Konsenzuálna sekvencia TATA boxu je TATAWAW, kde W je buď A alebo T. Je to nekódujúca sekvencia DNA. Pre transkripciu génu je však dôležitý TATA box. Je to väzobné miesto proteínu viažuceho TATA (TBP) a iných transkripčných faktorov. Akonáhle sa naviažu do TATA boxu, v eukaryotických génoch sa uskutoční nábor RNA polymerázy II a správna regulácia transkripcie.
Obrázok 01: TATA Box
Keďže TATA box sa podieľa na regulácii transkripcie, mutácie TATA boxu môžu viesť k fenotypovým zmenám vedúcim k ochoreniam, ako je rakovina žalúdka, spinocerebelárna ataxia, Huntingtonova choroba, slepota, β-talasémia, imunosupresia, Gilbertov syndróm, a HIV-1 atď.
Čo je CAAT Box?
CAAT box je oblasť nukleotidov s konsenzuálnou sekvenciou GGCCAATCT. Podobne ako TATA box, CAAT box je tiež umiestnený v promótorovej oblasti génu. Preto sa nachádza asi 75-80 párov báz proti smeru transkripcie od miesta transkripcie.
Obrázok 02: CAAT Box
Špecifické transkripčné faktory sa viažu na pole CAAT. Táto väzba stabilizuje prediniciačný komplex pre ľahšiu väzbu enzýmu RNA polymerázy. Podobne box CAAT funguje ako regulačná sekvencia. Mutácie v oblasti CAAT boxu výrazne ovplyvňujú odpoveď promótora a reguláciu transkripcie.
Aké sú podobnosti medzi TATA a CAAT Boxom?
- TATA a CAAT sú dve oblasti nukleotidov, ktoré sa nachádzajú v regulačnej sekvencii eukaryotických génov.
- Nachádzajú sa pred miestom iniciácie transkripcie.
- Obe sú konsenzuálne sekvencie DNA.
- Sú nevyhnutné pre reguláciu transkripcie, takže sú to regulačné sekvencie.
Aký je rozdiel medzi TATA a CAAT Boxom?
TATA box je konzervatívna nukleotidová oblasť nachádzajúca sa asi 25-30 párov báz proti smeru transkripcie od miesta iniciácie transkripcie. Na druhej strane, CAAT box je konzervovaná oblasť nukleotidov, ktorá sa nachádza asi 75-80 párov báz proti smeru transkripcie od miesta iniciácie transkripcie. Toto je kľúčový rozdiel medzi boxom TATA a CAAT. Okrem toho, TATA box má konsenzuálnu sekvenciu TATAWAW, zatiaľ čo GGCCAATCT je konsenzuálna sekvencia CAAT boxu.
Ďalším významným rozdielom medzi TATA a CAAT boxom je navyše to, že TATA box poskytuje väzbové miesto pre TBP a transkripčné faktory a podieľa sa na regulácii transkripcie, zatiaľ čo box CAAT signalizuje väzbové miesto pre RNA transkripčný faktor.
Pod infografikou sú zhrnuté rozdiely medzi boxom TATA a CAAT.
Zhrnutie – TATA vs CAAT Box
TATA box a CAAT box sú dve časti konzervovanej oblasti promótorov eukaryotických génov. Sú umiestnené proti prúdu od miesta iniciácie transkripcie. Obidva ovplyvňujú transkripciu génov tým, že poskytujú miesta pre väzbu proteínov viažucich TATA a faktorov iniciácie transkripcie. TATA box sa nachádza 25-35 párov báz proti smeru od miesta iniciácie transkripcie, zatiaľ čo box CAAT sa nachádza 75-80 párov báz proti smeru od miesta iniciácie transkripcie. Konsenzuálna sekvencia TATA boxu je TATAWAW, zatiaľ čo konsenzuálna sekvencia CAAT boxu je GGCCAATCT. Toto je zhrnutie rozdielu medzi boxom TATA a CAAT.
