Kľúčový rozdiel medzi avidínom a streptavidínom je ten, že avidín má vysokú afinitu a špecificitu k biotínu, ale porovnateľne menšiu afinitu ako streptavidín, pretože streptavidín-biotín je jedným z najsilnejších komplexov s nekovalentnou väzbou.
Avidín je typ proteínu, ktorý sa tvorí vo vajcovodoch vtákov, plazov a obojživelníkov. Streptavidín je typ proteínu, ktorý sa pripravuje purifikáciou baktérie Streptomyces avidinii.
Čo je Avidin?
Avidín je typ proteínu, ktorý sa tvorí vo vajcovodoch vtákov, plazov a obojživelníkov. Tento proteín je tetramérny proteín viažuci biotín, ktorý sa ukladá v bielku vajec. Okrem tetramérnych foriem existujú dimérne členy avidínu. Tieto dimérne formy môžeme nájsť u niektorých baktérií. Keď vezmeme do úvahy vaječný bielok, má asi 0,05 % avidínu v pomere k celkovému obsahu bielkovín.
Obrázok 01: Chemická štruktúra a vzhľad molekuly avidínu
V tetramérnom proteíne sú štyri identické podjednotky. Preto ho môžeme nazvať homotetramér. Každý tetramér sa môže viazať s biotínom (nazývaným aj vitamín B7). Afinita a špecifickosť tejto väzby sú veľmi vysoké. Komplex avidín-biotín je jednou z najsilnejších známych nekovalentných väzieb.
V surových vajciach nájdeme funkčný avidín. Pri varení sa afinita biotínu k avidínu zničí. Prirodzená funkcia vajíčka avidínu však zatiaľ nie je presne známa. Vedci predpokladajú, že tento proteín sa tvorí vo vajcovode vajíčka ako inhibítor rastu baktérií. Môže sa viazať s biotínom (biotín je užitočný pre rast baktérií).
Okrem toho existuje neglykozylovaná forma avidínu dostupná ako komerčný produkt. Stále nie je známe, či sa táto neglykozylovaná forma vyskytuje prirodzene alebo nie. Existuje niekoľko dôležitých aplikácií tohto proteínu, vrátane výskumných aplikácií, biochemických testov, čistiacich médií atď.
Čo je Streptavidín?
Streptavidín je typ proteínu, ktorý sa pripravuje purifikáciou baktérie Streptomyces avidinii. Je to tetramér. Existujú homo-tetraméry streptavidínu, ktoré majú mimoriadne vysokú afinitu k biotínu. Je známe, že väzba biotínu na streptavidín je jednou z najsilnejších nekovalentných interakcií v prírode. Tento proteín je užitočný v molekulárnej biológii a bionanotechnológii vďaka odolnosti komplexu streptavidín-biotín voči organickým rozpúšťadlám, denaturantom, proteolytickým enzýmom, extrémnym teplotám, hodnotám pH a detergentom.
Obrázok 02: Štruktúra a vzhľad molekuly streptavidínu
Existujú dôležité aplikácie streptavidínu, ako je čistenie alebo detekcia rôznych biomolekúl, čistenie a detekcia geneticky modifikovaných peptidov, vo Western blotting, vývoji nanobiotechnológie atď.
Aký je rozdiel medzi avidínom a streptavidínom?
Avidín je typ proteínu, ktorý sa tvorí vo vajcovodoch vtákov, plazov a obojživelníkov. Streptavidín je typ proteínu, ktorý sa pripravuje purifikáciou baktérie Streptomyces avidinii. Kľúčový rozdiel medzi avidínom a streptavidínom je v tom, že avidín má vysokú afinitu a špecifickosť pre biotín, ale porovnateľne menšiu afinitu ako streptavidín, pretože streptavidín-biotín je jedným z najsilnejších komplexov, ktoré majú nekovalentnú väzbu.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi avidínom a streptavidínom v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – Avidin vs Streptavidin
Avidín a streptavidín sú dôležité proteíny. Kľúčový rozdiel medzi avidínom a streptavidínom je v tom, že avidín má vysokú afinitu a špecificitu k biotínu, ale porovnateľne menšiu afinitu ako streptavidín, pretože streptavidín-biotín je jedným z najsilnejších komplexov, ktoré majú nekovalentnú väzbu.
