Kľúčový rozdiel medzi Cosmidom a Phagemidom je v type sekvencií, ktoré obsahuje. Kozmid obsahuje miesto cos a plazmid. Preto je to hybridný vektor, zatiaľ čo fagemid je plazmid, ktorý obsahuje F1 počiatok replikácie fágu F1.
Kozmidy a fagemidy sa používajú na účely klonovania, najmä na klonovanie väčších fragmentov DNA. Tie majú široké využitie najmä pri klonovaní génov zodpovedných za produkciu rôznych proteínov. Kozmidy a fagemidy sa buď replikujú samostatne ako plazmidy, alebo sa zabalia do vírusových častíc a potom sa replikujú.
Čo je to kozmid?
Kozmid, označovaný ako hybridný plazmid, obsahuje miesta cos extrahované z častíc fágu Lambda a plazmidu. Tieto miesta cos sú dlhé fragmenty DNA s 200 pármi báz. Preto majú kohézne alebo lepkavé konce, ktoré umožňujú plazmidu zapadnúť do vírusovej DNA. Preto sú miesta cos životne dôležité pre balenie DNA.
Sú tri stránky cos;
- miesto cosN – podieľa sa na prerezaní vlákna DNA aktivitou terminázy
- stránka cosB – zapojená do držania koncovky.
- miesto cosQ – podieľa sa na prevencii degradácie DNA DNázami.
Obrázok 01: Cosmid
Kozmidy môžu tiež replikovať jednovláknovú DNA alebo dvojvláknovú DNA pomocou vhodného začiatku replikácie. Kozmidy zvyčajne obsahujú gény rezistencie na antibiotiká ako markery na selekciu transformantov. Použitie kozmidu ako vektora teda môže uľahčiť klonovanie a štiepenie vektora reštrikčnými enzýmami potom môže extrahovať tieto fragmenty.
Čo je fagemid (Phasmid)?
Fagemid, tiež nazývaný Phasmid, je tiež typom hybridného vektora. Fagemid obsahuje špeciálny počiatok replikácie nazývaný ako f1 počiatok replikácie. Extrakty počiatku replikácie f1 z fágu f1.
Fagemid dokáže replikovať jednovláknovú aj dvojvláknovú DNA. Replikácia môže prebiehať buď ako plazmid, pričom prebieha nezávislá replikácia, alebo sa môže zabaliť do fágových častíc a nakoniec infikovať bakteriálneho hostiteľa E coli. Pri infekcii buniek E coli vyžaduje fág f1 prítomnosť pilusu. Preto sú sexuálne pili dôležité počas balenia fagemidov in vitro.
Aké sú podobnosti medzi kozmidom a fagemidom?
- Cosmid aj Phagemid sú klonovacie vektory používané v technológii rekombinantnej DNA.
- Kozmid a fagemid dokážu replikovať jednovláknovú a dvojvláknovú DNA.
- Obidva môžu podstúpiť nezávislú replikáciu podobne ako plazmidy.
- Kozmid a fagemid môžu podstúpiť balenie in vitro a infikovať bakteriálne bunky.
- Kozmid aj fagemid vyžadujú na klonovanie vhodný začiatok replikácie.
Aký je rozdiel medzi kozmidom a fagemidom?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid je hybridný vektor, ktorý obsahuje miesto cos a plazmid. | Fagemid je plazmid, ktorý obsahuje F1 počiatok replikácie fágu F1. |
| Prítomnosť stránok Cos | |
| Miesta Cos sa nachádzajú v kozmide a sú potrebné na balenie in vitro. | Vo fagemide chýbajú weby Cos. |
| Prítomnosť F1 Origin of Replication | |
| V kozmide môže, ale nemusí byť prítomný fi pôvod replikácie. | F1 počiatok replikácie je prítomný vo fagemide. |
| Prítomnosť génov odolných voči antibiotikám | |
| Gény odolné voči antibiotikám sú prítomné v kozmidoch na identifikáciu transformantov od netransformantov. | Gény odolné voči antibiotikám vo fagemidoch chýbajú. |
| Požiadavka na balenie in vitro | |
| Vyžaduje web cos. | Vyžaduje sexuálny pilus. |
Zhrnutie – Cosmid vs Phagemid
Cosmid a Phagemid sú klonovacie vektory používané v technológii rekombinantnej DNA. Kozmidy sú hybridné vektory, ktoré obsahujú špeciálne lepkavé konce známe ako cos miesta. In-vitro balenia vyžadujú tieto cos stránky. Zatiaľ čo fagemidy sú plazmidy, ktoré obsahujú f1 počiatok replikácie extrahovaný z f1 fágu. Kozmid aj fagemid môžu podstúpiť nezávislú replikáciu alebo in vitro balenie do bakteriálnych buniek. Toto sú dôležité rozdiely medzi kozmidom a fagemidom.
