Kľúčový rozdiel medzi 16s a 18s rRNA je v tom, že 16s rRNA je súčasťou podjednotky 30S v prokaryotických ribozómoch, zatiaľ čo 18s rRNA je súčasťou podjednotky 40S v eukaryotických ribozómoch.
Ribozomálna RNA alebo rRNA je štrukturálny komponent ribozómov. rRNA sa podieľa na mechanizme syntézy proteínov. Ribozómy eukaryotov a prokaryotov sa líšia. Eukaryoty majú 80-ročné ribozómy, zatiaľ čo prokaryoty majú 70-ročné ribozómy. Zloženie rRNA sa medzi týmito dvoma ribozómami tiež líši. Zatiaľ čo malé podjednotky eukaryotického ribozómu obsahujú 18s rRNA, malé podjednotky prokaryotického ribozómu obsahujú 16s rRNA.
Čo je 16s rRNA?
16srRNA alebo 16s ribozomálna RNA je súčasťou 30s podjednotky prokaryotického ribozómu. Preto je súčasťou malej podjednotky ribozómu. 16s rRNA hrá dôležitú úlohu pri stabilizácii translačného mechanizmu spolu s ribozómom. 16s rRNA sa viaže na Lesk Dalgarnovu sekvenciu prokaryotickej mRNA, aby iniciovala transláciu. Viaže sa tiež s 23s rRNA, aby zostavil malé a veľké podjednotky ribozómu.
Obrázok 01: 16s rRNA
Gén 16s rRNA je prítomný v genóme všetkých baktérií. Je to dlhá, špecifická a vysoko konzervovaná oblasť bakteriálneho genómu. Preto je detekcia oblasti 16s rRNA v baktériách dôležitým krokom vo fylogenetickej identifikácii baktérií. V tomto ohľade môžu byť univerzálne priméry navrhnuté tak, aby amplifikovali oblasť 16s rRNA, po ktorej nasledovalo sekvenovanie.
Čo je 18s rRNA?
18s rRNA alebo 18s ribozomálna RNA je súčasťou eukaryotickej ribozomálnej podjednotky 40s. Je teda súčasťou malej podjednotky eukaryotického ribozómu. 18s rRNA spojená s ribozómom hrá dôležitú úlohu pri iniciácii translácie v eukaryotoch.
Obrázok 02: 18s rRNA
Gén kódujúci 18s rRNA je gén 18s rRNA. Sekvencia z tohto génu je dôležitá v molekulárnej analýze na rekonštrukciu evolučnej histórie organizmov, pretože ide o vysoko konzervované oblasti. 18s rRNA má vysoké rozlíšenie pre taxonomické štúdie v hubách, kde sa oblasť interného transkribovaného spacera (ITS) 18s rRNA používa hlavne na štúdie diverzity húb ako marker fungálneho čiarového kódu. Región ITS sa väčšinou používa v metagenomickej analýze.
Aké sú podobnosti medzi 16s a 18s rRNA?
- 16s a 18s rRNA sú súčasťou malej podjednotky ribozómu.
- V cytoplazme sa nachádzajú 16s aj 18s rRNA.
- Oba majú zodpovedajúce gény so špecifickou sekvenciou.
- Oboje je navyše dôležité pri iniciácii prekladu.
- Zohrávajú dôležitú úlohu vo fylogenetickej analýze.
- Okrem toho sú dôležité pri predpovedaní vývoja druhov.
Aký je rozdiel medzi 16s a 18s rRNA?
16s RNA sa nachádza ako zložka v 30. podjednotke prokaryotického ribozómu. 18s rRNA sa nachádza ako súčasť 40s podjednotky eukaryotického ribozómu. Toto je kľúčový rozdiel medzi 16s a 18s rRNA. 16s rRNA je prítomná v prokaryotoch, zatiaľ čo 18s rRNA je prítomná v eukaryotoch. Okrem toho je gén, ktorý kóduje 16s rRNA, dôležitý pri identifikácii a taxonómii bakteriálnych druhov, zatiaľ čo gén 18s rRNA je dôležitý pri identifikácii a klasifikácii húb.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi 16s a 18s rRNA v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Súhrn – 16s vs 18s rRNA
Ribozomálna RNA alebo rRNA sú štrukturálne zložky ribozómu a tvoria rozsiahle sekundárne štruktúry pri rozpoznávaní konzervovaných častí mRNA a tRNA. 16srRNA je súčasťou 30. podjednotky prokaryotického ribozómu. 18s rRNA je súčasťou 40s podjednotky eukaryotického ribozómu. Toto je kľúčový rozdiel medzi 16s a 18s rRNA. Obidve však tvoria časť malej podjednotky ribozómu. Gény, ktoré kódujú 16s aj 18s rRNA, hrajú dôležitú úlohu vo fylogenetickej analýze druhov, pretože tieto gény sú vysoko konzervované.