Kľúčový rozdiel – všeobecné a špecifické transkripčné faktory
Trankripčné faktory vyžaduje RNA polymeráza, aby pôsobila na reťazec templátu DNA pri syntéze mRNA. Existujú rôzne typy transkripčných faktorov. Tieto transkripčné faktory tvoria komplex s reťazcom DNA. Buď zmenia potvrdenie templátového reťazca alebo zvýšia afinitu enzýmu RNA polymerázy k syntéze mRNA v procese nazývanom transkripcia. Existujú dva hlavné typy transkripčných faktorov. Sú to všeobecné alebo bazálne transkripčné faktory a špecifické transkripčné faktory. Všeobecné transkripčné faktory sú faktory používané na vytvorenie pre-iniciačného komplexu počas procesu transkripcie. Sú prítomné takmer vo všetkých eukaryotoch a v prokaryotoch tvoria menej komplikovaný komplex. Špecifické transkripčné faktory sú buď zosilňovače alebo represory, čo sú špecifické sekvencie DNA, ktoré aktivujú alebo potláčajú všeobecný proces transkripcie. Niektoré špecifické transkripčné faktory môžu zmeniť samotnú sekvenciu DNA. Kľúčový rozdiel medzi všeobecnými transkripčnými faktormi a špecifickými transkripčnými faktormi je založený na funkčnosti. Všeobecné transkripčné faktory sa podieľajú na tvorbe pre-iniciačného komplexu transkripčného procesu, zatiaľ čo špecifické transkripčné faktory sa podieľajú buď na aktivácii alebo potlačení transkripčného procesu.
Čo sú všeobecné transkripčné faktory?
Všeobecné alebo bazálne transkripčné faktory sú faktory, ktoré sa podieľajú na tvorbe iniciačného komplexu počas transkripcie. Sú nevyhnutné pre proces transkripcie, a preto hrajú dôležitú úlohu pri úspešnej transkripcii. Existuje šesť kľúčových všeobecných transkripčných faktorov. Oni sú; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF a TFIIA. Počas formovania iniciačného komplexu hrajú rôzne úlohy.
- TFIID – Tento transkripčný faktor (TF) sa podieľa na rozpoznávaní promótorovej sekvencie (TATA box).
- TFIIB – Komplex promótor/TFIID rozpoznáva TFIIB. To poskytuje signál pre väzbu hlavného katalyzujúceho enzýmu RNA polymerázy.
- TFIIF – Tento transkripčný faktor sa viaže na RNA polymerázu. TFIIF sa teda podieľa na procese získavaním RNA polymerázy na správne miesto.
- TFIIE a TFIIH – Väzba týchto transkripčných faktorov znamená koniec tvorby prediniciačných faktorov. Naviazanie týchto faktorov zvyšuje efektivitu tvorby prediniciačného komplexu.
- TFIIA podporuje väzbu TFIID na TATA box.
Obrázok 01: Všeobecné transkripčné faktory
Vyššie uvedené všeobecné transkripčné faktory sú špecifické pre RNA polymerázu II, čo je typ RNA polymerázy, ktorá predlžuje reťazec mRNA. S RNA polymerázou I a III sa podieľajú všeobecné transkripčné faktory. Všeobecné transkripčné faktory sa môžu líšiť aj podľa typu bunky, na ktorú pôsobí.
Aké sú špecifické transkripčné faktory?
Špecifické transkripčné faktory sú oblasti, ktoré sa nachádzajú aj v sekvenciách DNA. Väčšinou sú to buď zosilňovače alebo represory. Špecifické transkripčné faktory sú špecifické cis-pôsobiace prvky v templátovom reťazci DNA, ktoré podliehajú transkripcii. Aktivácia týchto špecifických zosilňovačov a represorov sa podieľa na zvyšovaní afinity enzýmu zmenou orientácie molekuly DNA alebo pôsobením ako signálne oblasti. Špecifické transkripčné faktory sa tiež používajú na indukciu modifikácií reťazca templátu DNA. Tieto modifikácie zahŕňajú hlavne kovalentné modifikácie, ako je metylácia. Preto metylované oblasti DNA pôsobia ako špeciálne zosilňovače alebo represory procesu transkripcie.
Obrázok 02: Špecifické transkripčné faktory
Špecifické transkripčné faktory závisia od typu druhu a bežne sa nenachádzajú vo všetkých eukaryotoch. Tieto transkripčné faktory sú aktivované rôznymi metabolickými podmienkami prostredníctvom signálnych transdukčných dráh. Po aktivácii regulujú expresiu génu na transkripčnej úrovni.
Aké sú podobnosti medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi?
- V procese transkripcie sa vyžadujú obidva faktory.
- Oba faktory ovplyvňujú génovú expresiu organizmu.
- Oba faktory pomáhajú regulovať funkciu RNA polymerázy v procese transkripcie.
- Oba faktory sa vyskytujú väčšinou v eukaryotoch.
Aký je rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi?
Všeobecný verzus špecifický prepis |
|
| Všeobecné transkripčné faktory sú faktory, ktoré sa používajú na vytvorenie prediniciačného komplexu počas procesu transkripcie. | Špecifické transkripčné faktory sú buď zosilňovače alebo represory, čo sú špecifické sekvencie DNA, ktoré aktivujú alebo potláčajú všeobecný proces transkripcie. |
| Typ molekuly | |
| Všeobecné transkripčné faktory sú založené na bielkovinách. | Špecifické transkripčné faktory sú nukleotidové sekvencie. |
| Formation | |
| Všeobecné transkripčné faktory tvoria prediniciačný komplex počas iniciácie transkripcie. | Špecifické transkripčné faktory pôsobia ako zosilňovače alebo represory transkripcie. |
| Typy | |
| Existuje šesť hlavných typov; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE a TFIIA všeobecných transkripčných faktorov. | Špecifické transkripčné faktory sú hlavne kategorizované ako zosilňovače a represory. |
Súhrn – všeobecné verzus špecifické transkripčné faktory
Trankripčné faktory sú nevyhnutné pre reguláciu transkripcie a sú potrebné na zvýšenie účinnosti a presnosti procesu. Transkripčné faktory sú dva hlavné typy; Všeobecné/Bazálne a Špecifické. Všeobecné transkripčné faktory sa podieľajú na tvorbe pre-iniciačného komplexu počas transkripcie, zatiaľ čo špecifické transkripčné faktory sú oblasti v samotnej DNA, ktoré pôsobia ako zosilňovače alebo represory. Všeobecné transkripčné faktory sú založené na proteínoch a vyžadujú ich všetky eukaryoty. Nelíši sa široko a zostáva ako jednotné molekuly. Špecifický transkripčný faktor sa môže značne líšiť a závisí od genetickej výbavy jednotlivcov. Toto je rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi.
Stiahnite si PDF verziu všeobecných a špecifických transkripčných faktorov
Verziu tohto článku si môžete stiahnuť vo formáte PDF a použiť ju na offline účely podľa citácie. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi všeobecnými a špecifickými transkripčnými faktormi
