Kľúčový rozdiel medzi CDS a cDNA je v tom, že CDS alebo kódujúca sekvencia je súčasťou transkriptu, ktorý je skutočne preložený do proteínu, zatiaľ čo sekvencia cDNA je sekvencia DNA odvodená z mRNA reverznou transkripciou.
Gén je nukleotidová sekvencia, ktorá kóduje proteín. Pozostáva z rôznych oblastí ako promótorová oblasť, miesto iniciácie transkripcie, exóny, štart kodón, intróny a stop kodón. Preto má gén kódujúce aj nekódujúce sekvencie. Kódujúce sekvencie alebo CDS označujú exóny a dva kodóny, ktoré sú štartovacím kodónom a stop kodónom. Je to sekvencia, ktorá je v skutočnosti preložená do proteínu. Naproti tomu cDNA je sekvencia DNA odvodená z mRNA reverznou transkripciou.
Čo je CDS?
CDS alebo kódujúca sekvencia je časť génu, ktorá je v skutočnosti preložená do proteínu. Pozostáva z exónov a dvoch kodónov ako AUG kodónu a stop kodónu. Na rozdiel od cDNA CDS neobsahuje dve nepreložené oblasti: 5' UTR a 3“UTR. Navyše, intróny nie sú zahrnuté v CDS.
Obrázok 01: Postupnosť kódovania
V porovnaní s celým genómom a jednotlivcom sú kódujúce sekvencie malou časťou. Kódujúca sekvencia pozostáva z nukleotidovej sekvencie nevyhnutnej na vytvorenie aminokyselinovej sekvencie proteínu.
Čo je cDNA?
cDNA alebo komplementárna DNA je sekvencia DNA vytvorená zo sekvencie mRNA. Syntetizuje sa procesom nazývaným reverzná transkripcia. Enzým reverzná transkriptáza katalyzuje syntézu cDNA a sekvencia mRNA pôsobí ako templát pre syntézu cDNA. V zásade možno mRNA eukaryotických buniek extrahovať a purifikovať, aby sa vytvorila cDNA. Po skonštruovaní cDNA z mRNA môžu byť potom klonované do bakteriálnej bunky, aby sa vytvorili cDNA knižnice. cDNA knižnice sú dôležité pre analýzu kódujúcich oblastí, génových funkcií a expresie génov atď.
Obrázok 02: cDNA
Na rozdiel od kódujúcej sekvencie obsahuje cDNA dve UTR, ktoré sú 3’ UTR a 5’ UTR. Podobne ako kódujúca sekvencia, cDNA neobsahuje intróny.
Aké sú podobnosti medzi CDS a cDNA?
- CDS a cDNA sú nukleové kyseliny.
- Sú vyrobené z deoxyribonukleotidov.
- CDS aj CDNA neobsahujú intróny, čo sú nekódujúce oblasti.
- Obe obsahujú genetický kód alebo informáciu na produkciu proteínu.
Aký je rozdiel medzi CDS a cDNA?
CDS alebo kódujúca sekvencia je časť génu, ktorá je v skutočnosti preložená do proteínu. Na druhej strane, cDNA sekvencia je DNA sekvencia odvodená z mRNA reverznou transkripciou. Toto je kľúčový rozdiel medzi CDS a cDNA. Okrem toho CDS pozostáva z exónov a dvoch kodónov, ktorými sú štartovací kodón a stop kodón. Naproti tomu cDNA pozostáva z kompletnej sekvencie mRNA a dvoch UTR.
Navyše, syntéza cDNA sa robí umelo z mRNA reverznou transkripciou, zatiaľ čo CDS sa nachádzajú v genómovej DNA.
Infografika nižšie zobrazuje ďalšie porovnania, aby bolo možné rozoznať rozdiel medzi CDS a cDNA.
Zhrnutie – CDS vs cDNA
Kódujúca sekvencia a cDNA sú dva typy nukleotidových sekvencií. Kódujúca sekvencia leží v géne, zatiaľ čo cDNA sa syntetizuje umelo. Kódujúca sekvencia má exóny a dva kodóny, zatiaľ čo cDNA má sekvenciu mRNA a dve UTR. CDS aj cDNA majú iba nukleotidové sekvencie, ktoré sa skutočne prekladajú na proteín. Neobsahujú intróny. Na rozdiel od CDS proces syntézy cDNA vyžaduje enzým reverznej transkriptázy. Tiež cDNA sa môže konvertovať na cDNA knižnice. Toto sumarizuje rozdiel medzi CDS a cDNA.
