Kľúčový rozdiel medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou je v tom, že štrukturálna genomika je štúdium fyzickej povahy genómov vrátane sekvenovania a mapovania genómov, zatiaľ čo funkčná genomika je štúdium expresie a funkcie genómu.
Genomika je oblasť biológie, ktorá sa zaoberá štruktúrou, organizáciou, funkciou, evolúciou a mapovaním genómov živých organizmov. Zahŕňa tiež sekvenovanie genómov, určenie kompletného súboru proteínov kódovaných organizmom a fungovanie génov a metabolických dráh v organizme. Jednoducho povedané, genomika je rozsiahla štúdia skupiny génov. Štúdie sa preto vykonávajú na úrovni genómu. Štrukturálna genomika a funkčná genomika sú dve hlavné vetvy genomiky. Štrukturálna genomika sa zameriava na charakterizáciu a poskytnutie polohy celej skupine génov v genóme. Naproti tomu funkčná genomika sa zameriava na funkciu a vlastnosť.
Čo je štrukturálna genomika?
Štrukturálna genomika je štúdium fyzickej podstaty genómu. Štrukturálna genomika sa preto týka najmä sekvenovania a mapovania genómov. Úplnú sekvenciu genómov alebo kompletnú sadu proteínov v organizme určuje štrukturálna genomika. Genetické a fyzikálne mapy sú konštruované v štruktúrnej genomike. Štrukturálna genomika navyše zahŕňa aj sekvenovanie genómu a určenie trojrozmernej štruktúry každého proteínu kódovaného génmi genómu.
Čo je funkčná genomika?
Funkčná genomika je odvetvie genomiky, ktoré sa zaoberá expresiou génov a ich funkciami. Týka sa to aj vzoru génovej expresie a metabolických dráh. Funkčná genomika využíva obrovské množstvo údajov produkovaných genomickými projektmi na opísanie génových funkcií a interakcií.
Pri určovaní funkcií génov sa v genomike analyzuje aj transkripcia a translácia. Profilovanie expresie analyzuje, kedy a kde sú konkrétne gény exprimované. Určovanie funkcií špecifických génov sa vykonáva selektívnou mutáciou požadovaných génov.
Aké sú podobnosti medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou?
- Štrukturálna a funkčná genomika sú dve primárne vetvy genomiky.
- Obe štúdie sa zameriavajú na rôzne aspekty genómov.
Aký je rozdiel medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou?
Štrukturálna genomika je štúdia, ktorá sa pokúša sekvenovať celý genóm a mapovať genóm, zatiaľ čo funkčná genomika je štúdia, ktorá sa pokúša určiť funkciu všetkých génových produktov kódovaných genómom organizmu. Preto sa štrukturálna genomika zaoberá hlavne sekvenovaním a mapovaním genómu, zatiaľ čo funkčná genomika sa zaoberá hlavne štúdiom expresie a funkcie genómu. Toto je kľúčový rozdiel medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou. Okrem toho štrukturálna genomika určuje fyzickú povahu genómu, zatiaľ čo funkčná genomika určuje expresiu všetkých génov a ich funkcií.
Infografika nižšie zobrazuje ďalšie podrobnosti o rozdieloch medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou.
Zhrnutie – Štrukturálna verzus funkčná genomika
Štrukturálna a funkčná genomika sú dve domény genomiky. Štrukturálna genomika sa zameriava na sekvenovanie a mapovanie genómov. Pri sekvenovaní a poskytovaní polohy celej sady génov v genóme sa pokúša určiť štruktúru každého proteínu kódovaného genómom. Funkčná genomika sa na druhej strane zameriava na expresiu génov a ich funkcií a vlastností. Pokúša sa určiť interakcie génov a ich produktov. Toto sumarizuje rozdiel medzi štrukturálnou a funkčnou genomikou.
