Kľúčový rozdiel medzi DNA a proteínovým microarray je v tom, že DNA microarray je súbor mikroskopických škvŕn DNA pripojených k pevnému povrchu, ako je podložné sklíčko, zatiaľ čo proteínové microarray je usporiadanie purifikovaných proteínov na pevnom povrchu, ako je sklo snímka.
Microarray je laboratórium na čipovom (LOC) zariadení. Ide o miniatúrne, multiplexné, paralelné spracovávacie a detekčné zariadenie. Je to tiež dvojrozmerné pole na pevnom povrchu, ako je sklenené sklíčko alebo kremíková tenkovrstvová bunka. Microarray testuje veľké množstvo biologického materiálu pomocou vysokovýkonného skríningu. Prvým mikročipom bol protilátkový čip, ktorý predstavil Tse Wen Chang v roku 1983. Prvý génový čip predstavili v roku 1995 Ron Davis a Pat Brown na Stanfordskej univerzite. Preto sú DNA a proteínové mikročipy dva typy zariadení microarray.
Čo je DNA Microarray?
DNA microarray je zbierka mikroskopických škvŕn DNA pripevnených k pevnému povrchu, ako je podložné sklíčko. Vedci používajú DNA microarray na meranie expresie veľkého počtu génov súčasne. Používa sa tiež na genotypizáciu viacerých oblastí genómu. DNA microarray sa pripravuje pomocou robotických strojov. Tieto stroje usporiadajú stovky alebo tisíce génových sekvencií (sond) na jednom mikroskopickom sklíčku.
Obrázok 01: DNA Microarray
V mikropole DNA obsahuje každý bod DNA pikomoly (10−12 molov) špecifickej sekvencie DNA. Tieto DNA sekvencie sú tiež známe ako sondy alebo reportéry. Tieto sondy sú krátkym segmentom DNA génu alebo iného elementu DNA. Môžu hybridizovať s cDNA alebo CRNA vo vzorke za veľmi prísnych podmienok. Fluorescenčne značené sekvencie vzoriek, ktoré sa viažu na sondy, generujú signály, ktoré závisia od podmienok hybridizácie, ako je teplota. Preto sa táto metóda môže použiť na stanovenie relatívneho množstva sekvencií nukleových kyselín vo vzorke. Okrem toho je technika DNA microarray široko používaná v štúdiách génovej expresie, porovnávacích genómových štúdiách, kontrole kontaminácie potravín alebo bunkových kultúr patogénmi, hodnotení génových mutácií, identifikácii kandidátov na lieky, analýze genetických väzieb atď.
Čo je Protein Microarray?
Protein microarray je usporiadanie purifikovaných proteínov na pevnom povrchu, ako je podložné sklíčko. Je to metóda používaná na detekciu interakcií a aktivít proteínov. Používa sa tiež na stanovenie funkcií bielkovín vo veľkom meradle. Hlavnou výhodou proteínového mikročipu je, že je možné paralelne sledovať veľké množstvo proteínov. Proteín microarray je čip, ktorý pozostáva z nosného povrchu, ako je sklenené sklíčko, nitrocelulózová membrána, guľôčka alebo mikrotitračná platňa. Na tento pevný povrch sú naviazané záchytné proteíny (protilátky, antigény). Molekuly sondy zvyčajne označené fluorescenčným farbivom sa do poľa pridajú neskôr. Hybridizácia medzi sondou a imobilizovanými proteínmi vyžaruje fluorescenčný signál, ktorý môže byť detekovaný laserovým skenerom.
Obrázok 02: Protein Microarray
Prvé proteínové pole je protilátkové mikropole (protilátková matrica), ktoré bolo predstavené v roku 1983. Proteínové mikropole sú rýchle, automatizované, vysoko citlivé a ekonomické. Taktiež spotrebujú len malé množstvo vzoriek a činidiel. Okrem toho sa proteínové mikročipy široko používajú na diagnostiku chorôb, funkčnú analýzu proteínov, charakterizáciu protilátok a vývoj liečby.
Aké sú podobnosti medzi DNA a proteínovým mikropolom?
- DNA a proteínové microarray sú dva typy zariadení microarray.
- Obe zariadenia sú založené na princípe hybridizácie.
- Obe zariadenia využívajú sondy.
- Na detekciu hybridizácie používajú aj fluorescenčné signály.
- Obaja sú nesmierne nápomocní pri diagnostike chorôb v medicíne.
Aký je rozdiel medzi DNA a Protein Microarray?
DNA microarray je zbierka mikroskopických škvŕn DNA pripevnených k pevnému povrchu, ako je podložné sklíčko. Naproti tomu proteínové mikročipy sú usporiadaním purifikovaných proteínov na pevnom povrchu, ako je sklíčko. Toto je kľúčový rozdiel medzi DNA a proteínovým mikročipom. Okrem toho v DNA mikročipe sú vzorkou a sondou sekvencie DNA. Na druhej strane, v proteínovom mikročipe sú vzorka a sonda proteíny.
Nasledujúca infografika predstavuje rozdiely medzi DNA a proteínovým mikropolom v tabuľkovej forme.
Zhrnutie – DNA vs Protein Microarray
Microarray je vysokovýkonné a multiplexné laboratórium na čipe. Vyrába sa na princípe hybridizácie. DNA a proteínové microarray sú dva typy microarray zariadení. DNA microarray je súbor mikroskopických škvŕn DNA pripojených k pevnému povrchu, ako je sklíčko. Na druhej strane proteínové mikročipy sú usporiadaním purifikovaných proteínov na pevnom povrchu, ako je sklíčko. Toto je zhrnutie rozdielu medzi DNA a proteínovým microarray.
