Kľúčový rozdiel medzi motívom a doménou je v tom, že motív nie je nezávisle stabilný, zatiaľ čo doména je nezávisle stabilná.
Proteíny sú dôležité biologické makromolekuly prítomné v našom tele. Na druhej strane genetický kód génu rozhodne o aminokyselinovej sekvencii proteínu. Okrem toho majú proteíny primárne, sekundárne a terciárne štruktúry. Primárnou štruktúrou je aminokyselinová sekvencia polypeptidového reťazca. Keď sa polypeptidové reťazce navzájom skladajú, tvoria sekundárnu štruktúru proteínu. Alfa helixy, beta listy a supersekundárne štruktúry patria k sekundárnym štruktúram. Určité zoskupenia supersekundárnych prvkov sú známe ako proteínové motívy. Terciárna štruktúra proteínu sa týka jeho trojrozmernej štruktúry, ktorá rozhoduje o funkcii proteínu. Doména je zložená časť molekuly proteínu, ktorá je globulárna a má diskrétnu funkciu. Je to základná funkčná a trojrozmerná štruktúra proteínu.
Čo je motív?
Motív je určité zoskupenie supersekundárnych prvkov proteínov, ako sú alfa helixy a beta štruktúry. Sú to nejaké vzory prítomné v rôznych proteínoch. Motívy opisujú vzory skladania sekundárnych štruktúrnych prvkov a ich interakcie. Tieto vzory skladania sa stabilizujú podobnými väzbami, ktoré sú prítomné v terciárnych štruktúrach. Nie sú však také zložité ako terciárne štruktúry.
Obrázok 01: Motív
Sú to jednoduché kombinácie sekundárnych štruktúr bielkovín. Motív nie je sám o sebe stabilný. Okrem toho motívy vysvetľujú štruktúru proteínu, ale nepredpovedajú funkciu proteínu. Príkladmi proteínových motívov sú beta-alfa-beta motív, grécky kľúčový motív, beta sud, beta-meandrový motív atď.
Čo je doména?
Doména je základná, funkčná a trojrozmerná jednotka proteínu. Vykonáva konkrétnu funkciu. Jeden proteín môže mať niekoľko odlišných domén. Každá doména je nezávislou jednotkou. Je to guľovitá štruktúra. Je zodpovedný za špecifickú funkciu alebo interakciu. Domény možno použiť na vytvorenie hypotézy o funkcii necharakterizovaného proteínu. Pri analýze proteínu je nevyhnutné vziať do úvahy, pretože domény sú funkčné jednotky proteínu.
Obrázok 02: Tri rôzne domény pyruvátkinázy
Domény sú veľmi stabilné a kompaktné štruktúry. Dajú sa ľahko odlíšiť od iných regiónov. Pyruvátkináza má tri rozlišujúce domény, ako je znázornené na obrázku 02. Dĺžka domény sa môže meniť a priemerná dĺžka je 100 aminokyselín. Každá doména obsahuje hydrofóbne jadro postavené zo sekundárnych štruktúrnych jednotiek. Niekoľko domén spoločne tvorí terciárnu štruktúru proteínu.
Aké sú podobnosti medzi motívom a doménou?
- Motív a doména sú jednotky prítomné v samotných proteínových molekulách.
- Sú užitočné pri klasifikácii proteínových rodín.
Aký je rozdiel medzi motívom a doménou?
Motív je určité zoskupenie super sekundárnych prvkov proteínov, ako sú alfa helixy a beta štruktúry, zatiaľ čo doména je funkčnou jednotkou proteínu. Okrem toho je motív sekundárnou štruktúrou, zatiaľ čo doména je zodpovedná za terciárnu štruktúru proteínu. Navyše doména je nezávislá jednotka, na rozdiel od motívu. Doména tiež zobrazuje funkciu proteínu, zatiaľ čo motív nie je. Toto sú hlavné rozdiely medzi motívom a doménou. Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiel medzi motívom a doménou v tabuľkovej forme.
Zhrnutie – motív vs doména
Motív je usporiadanie sekundárnych štruktúr molekuly proteínu. Na rozdiel od domény nie je zvyčajne stabilná. Doména je nezávisle stabilná štruktúra proteínu. Preto to môže byť časť alebo celá molekula proteínu. Je to trojrozmerná základná funkčná jednotka proteínu. Okrem toho má funkciu a je to nezávislá jednotka. Motív môže byť súčasťou domény. Doména však nemôže byť súčasťou motívu. Toto je rozdiel medzi motívom a doménou.
