Kľúčový rozdiel medzi ORF a exónom je v tom, že ORF alebo otvorený čítací rámec je úsek sekvencie DNA, ktorý začína miestom iniciácie translácie (štart kodónom) a končí miestom terminácie translácie (stop kodónom), zatiaľ čo exón je nukleotidová sekvencia v géne, ktorý kóduje aminokyseliny.
Otvorený čítací rámec je súčasťou čítacieho rámca. Čítacie rámce čítajú ribozómy, aby vytvorili proteíny. ORF je súvislý úsek kodónov, ktorý poskytuje plne funkčný proteín. Začína štartovacím kodónom a končí stop kodónom. Vo vnútri ORF nie je žiadny stop kodón prerušujúci kódujúcu sekvenciu. Translácia začína štartovacím kodónom a končí stop kodónom. Exón je nukleotidová sekvencia génu. Kóduje aminokyseliny proteínu. Preto sú exóny kódujúce oblasti génu.
Čo je ORF?
Otvorený čítací rámec alebo ORF je súvislý úsek nukleotidovej sekvencie, ktorý začína štartovacím kodónom a končí stop kodónom. Jednoducho povedané, ORF označuje oblasť nukleotidovej sekvencie umiestnenú medzi štartovacím a stop kodónom. Medzi tým nie je žiadny stop kodón prerušujúci ORF. Nukleotidová sekvencia medzi štartovacím a stop kodónom kóduje aminokyseliny. Vo všeobecnosti je štartovacím kodónom ATG, zatiaľ čo stop kodónom sú TAG, TAA a TGA. ORF poskytuje funkčný proteín, keď je transkribovaný a translatovaný. Preto ORF zahŕňa štartovací kodón, niekoľko kodónov v strednej oblasti a stop kodón. Zaujímavé je, že ORF má dĺžku, ktorú možno deliť tromi.
Obrázok 01: ORF
Keďže v prokaryotoch neexistujú žiadne intróny, ORF je kódujúca oblasť génu, ktorý sa prepisuje priamo do mRNA. V eukaryotoch, keďže existujú intróny, je ORF kodónová sekvencia, ktorá vzniká po spracovaní alebo zostrihu RNA. ORF je dôkazom, ktorý pomáha predpovedať gény, pretože dlhé ORF sú pravdepodobne súčasťou génu.
Čo je to exón?
Exóny sú kódujúce nukleotidové sekvencie génov, ktoré sa premieňajú na proteíny. Sú na oboch stranách intrónu. Po odstránení nekódujúcich sekvencií z pre mRNA sa zrelá molekula mRNA skladá len z exónových sekvencií. Potom sa nukleotidová sekvencia konečnej molekuly RNA (zrelá mRNA) premení na aminokyselinovú sekvenciu špecifického proteínu.
Obrázok 02: Exóny
Takmer všetky gény majú počiatočnú nukleotidovú sekvenciu, ktorá ich odlišuje ako gén od hlavného reťazca DNA alebo RNA, ktorý je známy ako otvorený čítací rámec (ORF. V niektorých génoch dva ORF označujú celý gén a exóny sa nachádzajú v kódujúcej sekvencii. Aj keď to znie, že exóny sú vždy exprimované v génoch, existujú prípady, keď intrónové sekvencie zasahujú do exónu, aby spôsobili mutácie, a tento proces je známy ako exonizácia.
Aké sú podobnosti medzi ORF a Exonom?
- ORF aj exón sú nukleotidové sekvencie.
- Dlhé ORF a exóny sú súčasťou génu.
- Obe majú kódovacie sekvencie.
Aký je rozdiel medzi ORF a Exónom?
ORF a exón sú nukleotidové sekvencie. ORF označuje akýkoľvek úsek DNA sekvencie umiestnený medzi štartovacím kodónom a stop kodónom. Naproti tomu exón je kódujúca nukleotidová sekvencia génu, ktorý kóduje aminokyseliny. Toto je kľúčový rozdiel medzi ORF a exónom. Exóny sú časťami génu, zatiaľ čo dlhý ORF je pravdepodobne súčasťou génu. Okrem toho existujú intróny na oboch stranách exónu, zatiaľ čo ORF nezahŕňa intróny.
Infografika nižšie sumarizuje rozdiel medzi ORF a exónom vo forme tabuľky.
Zhrnutie – ORF vs Exon
Otvorený čítací rámec (ORF) je súčasťou čítacieho rámca. Je to súvislý úsek sekvencie DNA, ktorý začína štartovacím kodónom a končí stop kodónom. Exón je nukleotidová sekvencia génu. Kóduje časť sekvencie mRNA. Preto sú exóny časťami génovej sekvencie, ktoré sú exprimované v proteíne. Toto sumarizuje rozdiel medzi ORF a exónom.
