Kľúčový rozdiel medzi N-naviazanými a O-viazanými oligosacharidmi je v tom, že N-viazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa N atómov proteínov naviaže na cukor, zatiaľ čo O-naviazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa naviaže 0 atómov serínu alebo treonínu s cukor.
Oligosacharidy sú molekuly sacharidov, ktoré obsahujú tri až šesť jednotiek monosacharidov alebo jednoduchých cukrov. N-viazané oligosacharidy sú sacharidové molekuly, kde je oligosacharid pripojený k atómu dusíka. Na druhej strane O-viazané oligosacharidy sú typom uhľohydrátov, kde je molekula cukru pripojená k atómu kyslíka serínového alebo treonínového zvyšku v proteíne.
Čo sú to N-viazané oligosacharidy?
N-viazané oligosacharidy sú molekuly sacharidov, ktorých oligosacharidy sú pripojené k atómom dusíka. K tomu dochádza prostredníctvom procesu N-glykozylácie. Oligosacharidy sú sacharidové zlúčeniny obsahujúce niekoľko molekúl cukru. Tieto sa niekedy nazývajú „glykány“. V procese N-viazanej glykozylácie atóm dusíka zvyčajne pochádza z amidového dusíka asparagínového zvyšku proteínu. Tento proces je najlepšie opísaný v oblasti biochémie.
V mnohých eukaryotických proteínoch zvyčajne prebieha N-viazaná glykozylácia. Medzi eukaryotmi sa to vyskytuje vo veľkej miere v archaea, ale zriedkavo v baktériách. Môžeme určiť povahu N-viazaného oligosacharidu, ktorý je pripojený ku glykoproteínu prostredníctvom proteínu a bunky, v ktorej je exprimovaný. Typ N-viazaného oligosacharidu závisí aj od druhu organizmov.
V glykoproteíne sú zvyčajne dva typy väzieb: väzba medzi sacharidovými zvyškami v glykáne a väzba medzi glykánovým reťazcom a molekulou proteínu. Tam sú časti cukru navzájom spojené glykozidickými väzbami. Glykozidické väzby sú typicky C1-C4 väzby. Okrem toho si väzba medzi oligosacharidom a proteínovým zvyškom vyžaduje rozpoznanie konsenzuálnej sekvencie.
Čo sú O-viazané oligosacharidy?
O-viazané oligosacharidy sú typom sacharidov, kde je molekula cukru pripojená k atómu kyslíka serínového alebo treonínového zvyšku v proteíne. Proces tvorby tejto väzby je známy ako O-viazaná glykozylácia. Ide o post-prechodný proces modifikácie, ktorý prebieha po syntéze proteínu.
Keď vezmeme do úvahy eukaryoty, k tejto syntéze dochádza v endoplazmatickom retikule, Golgiho aparáte a niekedy aj v cytoplazme. U prokaryotov sa to deje v cytoplazme. Existuje niekoľko rôznych typov cukrov, ktoré sa môžu viazať so serínom alebo treonínom. Táto väzba môže ovplyvniť proteín rôznymi spôsobmi. napr. obchodovanie s bunkami v imunitnom systéme, čo umožňuje rozpoznanie cudzieho materiálu.
Aký je rozdiel medzi N-viazanými a O-viazanými oligosacharidmi?
N-viazané oligosacharidy sú sacharidové molekuly, kde je oligosacharid pripojený k atómu dusíka, zatiaľ čo O-viazané oligosacharidy sú typom sacharidov, kde je molekula cukru pripojená k atómu kyslíka serínového alebo treonínového zvyšku v bielkoviny. Kľúčový rozdiel medzi N-naviazanými a O-viazanými oligosacharidmi je teda v tom, že N-viazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa atóm dusíka proteínov naviaže na cukor, zatiaľ čo O-naviazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa atómy O serínu alebo treonínu viažu na cukor.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi N-viazanými a O-viazanými oligosacharidmi v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Súhrn – N-viazané verzus O-viazané oligosacharidy
Oligosacharidy sú typom molekuly cukru. Kľúčový rozdiel medzi N-naviazanými a O-viazanými oligosacharidmi je v tom, že N-viazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa N atómov proteínov naviaže na cukor, zatiaľ čo O-naviazané oligosacharidy sa tvoria, keď sa O atómy serínu alebo treonínu naviažu na cukor.
