Kľúčový rozdiel medzi replikatívnou transpozíciou a transpozíciou vystrihnúť a prilepiť je v tom, že pri replikačnej transpozícii sa transpozón skopíruje na nové miesto, zatiaľ čo pri transpozícii vystrihnúť a prilepiť sa transpozón presunie na nové miesto.
Transponovateľné elementy alebo skokové gény sú sekvencie DNA, ktoré môžu zmeniť svoju pozíciu v genóme. Toto sa označuje ako transpozícia. Transpozícia môže niekedy vytvoriť alebo zvrátiť mutácie a zmeniť genetickú identitu bunky a veľkosť genómu. Transpozícia bola objavená Barbarou McClintock v roku 1983. Transpozícia sa môže uskutočniť dvoma technikami, ako je duplikácia a vystrihnutie a prilepenie.
Čo je replikačná transpozícia?
Replikatívna transpozícia je typ transpozičného mechanizmu, ktorý napomáha excízii transpozónu z natívneho miesta na iné prostredníctvom replikovanej alebo duplikovanej techniky. Tento mechanizmus prvýkrát objavil James A Shapiro v roku 1979. V tomto mechanizme sa transponovateľný prvok počas transpozičnej reakcie duplikuje, takže transponujúca entita je kópiou pôvodného prvku. Navyše v tomto mechanizme tvoria donorové a receptorové DNA sekvencie charakteristickú medziľahlú konfiguráciu „theta“nazývanú Shapiro intermediát (kointegrovaný). Replikatívna transpozícia je charakteristický retrotranspozón. Tento mechanizmus sa bežne vyskytuje v transpozónoch I. triedy.
Obrázok 01: Replikatívna transpozícia
Dobrý príklad replikatívnej transpozície možno pozorovať v transpozóne E. coli TN3. Transpozón TN3 sa môže presunúť z pôvodného plazmidu do iného cieľového plazmidu prostredníctvom replikovanej alebo duplikovanej techniky. Celá táto udalosť je sprostredkovaná dvoma dôležitými enzýmami nazývanými transpozáza a resolváza. Okrem toho je možné pozorovať replikatívnu transpozíciu v transpozónoch DNA aj retropozónoch. Najlepšie preštudovaným transponovateľným bakteriálnym vírusom je bakteriofág Mu.
Čo je to vystrihnúť a prilepiť transpozícia?
Transpozícia Cut and paste je typ transpozičného mechanizmu, ktorý pomáha transpozónovej excízii z natívneho miesta na iné prostredníctvom techniky cut and paste. Tento mechanizmus je známy aj ako konzervatívny model transpozície. V tejto nereplikatívnej transpozícii prebieha excízia a integrácia transpozónu z jedného genómového miesta do druhého bez zanechania kópie.
Obrázok 02: Transpozícia Vystrihnúť a prilepiť
V tomto mechanizme sa enzým transpozáza najskôr viaže na koncové repetície, ktoré sú zvyčajne prítomné na oboch koncoch transpozónov, a potom vytvorí štruktúru nazývanú synaptický komplex (transpozozóm). Synaptický komplex štiepi transpozón z jeho pôvodného genómového miesta a integruje ho do nového cieľového miesta. Potom transpozázy odchádzajú z oboch koncov transpozónu. Akonáhle enzým transpozáza opustí transpozón, medzery vyplní hostiteľský enzým polymeráza. To umožňuje úplné spojenie transpozónu s novým genómovým umiestnením. Tento mechanizmus sa bežne vyskytuje v transpozónoch triedy II. Okrem toho sú bakteriálne transpozóny TN5 dobre známym príkladom, ktorý ukazuje mechanizmus konzervatívnej transpozície alebo mechanizmu vystrihnutia a vloženia.
Aké sú podobnosti medzi replikatívnou transpozíciou a vystrihnutím a prilepením?
- Replikatívna transpozícia a vystrihnutie a prilepenie sú dva typy transpozičných mechanizmov.
- V oboch mechanizmoch sa transponovateľné prvky presúvajú z jedného genómového miesta do iného nového genómového miesta.
- Oba mechanizmy môžu vytvárať alebo zvrátiť mutácie a meniť genetickú identitu bunky.
- Bakteriálne transpozóny vykazujú oba mechanizmy.
- Sú to mimoriadne dôležité udalosti pre evolúciu.
Aký je rozdiel medzi replikatívnou transpozíciou a vystrihnutím a prilepením?
Replikatívna transpozícia je typ transpozičného mechanizmu, pri ktorom sa transpozón skopíruje na nové miesto, zatiaľ čo vystrihnutie a prilepenie je typ transpozičného mechanizmu, pri ktorom sa transpozón presunie na nové miesto. Toto je kľúčový rozdiel medzi replikatívnou transpozíciou a transpozíciou vystrihnúť a prilepiť. Okrem toho, replikatívna transpozícia sa bežne vyskytuje v transpozónoch triedy I, zatiaľ čo transpozícia cut and paste sa bežne vyskytuje v transpozónoch triedy II.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi replikatívnou transpozíciou a vystrihnutím a prilepením v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – Replikatívna transpozícia verzus vystrihnutie a prilepenie transpozícia
Replikatívna transpozícia a transpozícia vystrihnutím a prilepením sú dva typy transpozičných mechanizmov. Replikatívna transpozícia je typ transpozičného mechanizmu, kde sa transpozón skopíruje na nové miesto, zatiaľ čo transpozícia vystrihnúť a vložiť je typ transpozičného mechanizmu, pri ktorom sa transpozón presunie na nové miesto. Toto teda sumarizuje rozdiel medzi replikatívnou transpozíciou a vystrihnutím a prilepením.
