Kľúčový rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom je v tom, že haploskupina označuje skupinu podobných haplotypov, ktoré majú spoločného predka, zatiaľ čo haplotyp označuje súbor alel, ktoré sa spolu dedia z generácie na generáciu v dôsledku genetického prepojenia.
Gén primárne pozostáva z dvoch alel. V chromozómoch sú prítomné tisíce génov. Pri segregácii vykazujú kríženia a genetické rekombinácie. Niektoré alely génov sú však umiestnené veľmi blízko seba. Jednoducho povedané, tieto alely vykazujú genetickú väzbu. Nie je teda pravdepodobné, že by sa krížili alebo rekombinovali. Namiesto toho majú vždy tendenciu prenášať sa spolu z generácie na generáciu. V súlade s tým je haplotyp kombináciou alel alebo súborom jednonukleotidových polymorfizmov prítomných na rovnakom chromozóme, ktoré sa spoločne dedia po generácie od jedného rodiča. Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré majú spoločného predka.
Čo je Haplogroup?
Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré majú spoločného predka. Inými slovami, haploskupina je kombinácia alel prítomných v rôznych chromozómoch, ktoré sa dedia spolu. Tieto alely sú prítomné veľmi blízko seba. Haplotypy v haploskupine majú podobné vzory a sú príbuznými potomkami, pretože majú spoločného predka. Preto je ľahké predpovedať haploskupinu z haplotypov.
Obrázok 01: Haplogroup
U ľudí existujú dve najbežnejšie haploskupiny. Sú to haploskupiny chromozómu Y, ktoré prechádzajú z otca na syna, a haploskupiny mitochondriálnej DNA, ktoré prechádzajú z matky na dcéru alebo syna.
Čo je to haplotyp?
Haplotyp je súbor alel zdedených spoločne. Tieto alely sú prítomné v tom istom chromozóme veľmi blízko pri sebe kvôli genetickej väzbe. Preto neexistuje žiadna šanca na rekombináciu alebo kríženie. Preto spolu prechádzajú z generácie na generáciu. Tieto alely môžu byť alely jedného génu alebo alely viacerých génov. Haplotyp môže tiež odkazovať na zhluk jednonukleotidových polymorfizmov prítomných na rovnakom chromozóme. Ide teda o súbor variácií DNA alebo polymorfizmov zdedených spoločne.
Obrázok 02: Polymorfizmus jedného nukleotidu
Informácie o haplotypoch sú užitočné pri skúmaní vplyvu génov na choroby. Analýzou haplotypov a haplotypových stromov môžu genetici odhaliť oblasti genómu súvisiace s chorobami a určiť vzory genetických variácií súvisiacich s chorobami. Okrem toho sú užitočné pri mapovaní génov pri umiestňovaní genetických markerov na správne miesta na chromozómoch.
Aké sú podobnosti medzi haploskupinou a haplotypom?
- Haploskupina pozostáva z podobných haplotypov.
- Vykazujú genetické väzby.
- Crossovery alebo genetická rekombinácia v haplotypoch a haploskupinách chýbajú.
Aký je rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom?
Haploskupina je kombinácia alel prítomných v rôznych chromozómoch, ktoré sa dedia spolu. Pozostáva z podobných haplotypov zdieľajúcich spoločného predka. Haplotyp, na druhej strane, je súbor alel nachádzajúcich sa v rovnakom chromozóme, ktoré sa spolu dedia po celé generácie. Toto je kľúčový rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom.
Nasledujúca infografika sumarizuje rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom.
Zhrnutie – Haploskupina vs Haplotyp
Haploskupina je skupina podobných haplotypov, ktoré majú spoločného predka. Haplotyp je na druhej strane kombináciou alel alebo súboru jednonukleotidových polymorfizmov prítomných na tom istom chromozóme, ktoré sa prenášajú generáciami od jedného rodiča. Preto je to kľúčový rozdiel medzi haploskupinou a haplotypom. Haplotypy poskytujú jednoduchý spôsob predpovedania haploskupín, pretože haploskupina pozostáva z podobných haplotypov.