Kľúčový rozdiel medzi dATP a ddATP je v tom, že dATP neukončuje syntézu DNA, zatiaľ čo ddATP je schopný ukončiť syntézu DNA. Dôvodom je skutočnosť, že ddATP má atóm vodíka pripojený k polohe 3' pentózového cukru, zatiaľ čo dATP má k polohe 3' pripojenú skupinu OH.
dNTP sú stavebné kamene DNA. Existujú štyri typy dNTP podľa purínových alebo pyrimidínových báz - dATP jedna z nich. Dusíkatou bázou dATP je adenozín. ddNTP sú nukleotidy používané v Sangerovom sekvenovaní. Existujú štyri typy ddNTP. ddATP je ddNTPs.
Čo je dATP?
Deoxyadenozíntrifosfát je nukleotid, ktorý je stavebným kameňom DNA. Enzým DNA polymeráza využíva dATP ako substrát pre syntézu DNA. dATP má tri zložky: molekulu deoxyribózového cukru, adenozín a tri fosfátové skupiny. Ide teda o purínový nukleozidtrifosfát. Chemický vzorec dATP je C10H16N5O12 P3, a jeho molekulová hmotnosť je 491,182.
Obrázok 01: dATP
dATP sa líši od ATP (adenozíntrifosfátu) z hľadiska zložiek cukru. ATP má ribózový cukor. dATP sa počas transkripcie páruje s uracilovým nukleotidom. Okrem účasti na syntéze DNA môže dATP pôsobiť aj ako molekula prenášajúca energiu, aby sa zachovala aj životaschopnosť buniek. Vysoká hladina dATP v tele je toxická, pretože môže pôsobiť ako nekompetitívny inhibítor enzýmu ribonukleotidreduktázy. Môže to viesť k narušeniu imunitnej funkcie.
Čo je ddATP?
Dideoxyadenozín triphoafát alebo ddATP je jedným zo štyroch typov nukleotidov používaných v Sangerovej sekvenačnej metóde. Štrukturálne má ddATP tiež tri zložky podobné dATP. Sú to adenínová báza, deoxyribózový cukor a tri fosfáty.
Obrázok 02: ddATP
Na rozdiel od dATP, ddATP nemá OH skupinu v polohe 3' pentózového cukru, aby vytvorila fosfodiesterovú väzbu so susedným nukleotidom a pokračovala v predlžovaní reťazca. Má atóm H v polohe 3. Preto akonáhle je ddATP začlenený, syntéza DNA sa končí. Je to základný princíp Sangerovho sekvenovania. Preto ddATP funguje ako inhibítor predlžovania reťazca v Sangerovom sekvenovaní. V Sangerovom sekvenovaní sa používajú štyri skúmavky a do jednej skúmavky sa pridá ddATP.
Aké sú podobnosti medzi dATP a ddATP?
- dATP a ddATP sú nukleotidy.
- Obe sa skladajú z adenínu, deoxyribózy a troch fosfátov.
- Sú to organické zlúčeniny.
- DATP aj ddATP sa pridávajú do skúmaviek v Sangerovom sekvenovaní.
Aký je rozdiel medzi dATP a ddATP?
dATP má OH skupinu v 3' polohe pentózového cukru, zatiaľ čo ddATP nemá OH skupinu v 3' polohe pentózového cukru. Okrem toho je dATP monomér používaný pri syntéze DNA, zatiaľ čo ddATP sa používa na ukončenie predlžovania reťazca počas Sangerovho sekvenovania. Toto je kľúčový rozdiel medzi dATP a ddATP. Navyše dATP môže tvoriť fosfodiesterové väzby, zatiaľ čo ddATP nemôže tvoriť fosfodiesterové väzby.
Infografika nižšie zobrazuje ďalšie rozdiely medzi dATP a ddATP v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – dATP vs ddATP
Stručne povedané, dATP je prekurzorom syntézy DNA, zatiaľ čo ddATP je nukleotid používaný na ukončenie syntézy DNA v Sangerovom sekvenovaní. Okrem toho má dATP OH skupinu v polohe 3' pentózového cukru a umožňuje vytvorenie fosfodiesterovej väzby s nasledujúcim nukleotidom. Medzitým ddATP nemá OH skupinu v polohe 3'; preto nie je schopný vytvoriť fosfodiesterovú väzbu s ďalším nukleotidom. Výsledkom je, že sekvencia DNA prestane predlžovať. Toto sumarizuje rozdiel medzi dATP a ddATP.
