Kľúčový rozdiel – zakorenený a nezakorenený fylogenetický strom
Fylogenéza je dôležitá oblasť, ktorá skúma život na Zemi v priebehu času. Odhaľuje spojenie medzi organizmami s ich predkami a potomkami. Vzťahy medzi organizmami sú schematicky reprezentované rôznymi stromovými reprezentáciami, ako je dendogram, kladogram, fenogram, fylogogram atď. Fylogenetický strom je vetviaci stromovitý diagram, ktorý vysvetľuje fylogenetické vzťahy medzi organizmami s veľkosťou evolučnej vzdialenosti. Existujú dva hlavné typy fylogenetických stromov známe ako zakorenené a nezakorenené. Kľúčový rozdiel medzi zakoreneným a nezakoreneným fylogenetickým stromom je ten, že zakorenený strom ukazuje najzákladnejšieho predka stromu, zatiaľ čo nezakorenený fylogenetický strom nevykazuje predok.
Čo je to zakorenený fylogenetický strom?
Zakorenený fylogenetický strom slúži ako užitočný diagram, ktorý ukazuje evolučnú históriu. Má bazálny uzol, ktorý sa nazýva koreň a predstavuje spoločného predka všetkých skupín stromu. Koreň stromu sa považuje za najstarší bod v strome, ktorý predstavuje posledného spoločného predka všetkých skupín zahrnutých v strome. Zakorenený strom teda ukazuje smer evolučného času. Z jedného druhu zakoreneného stromu možno nájsť spoločného predka alebo predka druhu vysledovaním späť k bazálnemu uzlu. Keďže zakorenený strom zobrazuje smer evolučného času, je ľahké nájsť staršie alebo novšie skupiny, ktoré má. Zakorenený strom môže byť použitý na štúdium celých skupín organizmov. Presné zakorenenie fylogenetického stromu je dôležitým a rozhodujúcim faktorom, pretože nepresné zakorenenie môže viesť k nesprávnej interpretácii genetických zmien medzi organizmami a ich smerovosti evolúcie.
Obrázok 01: Zakorenený fylogenetický strom
Čo je to nezakorenený fylogenetický strom?
Nezakorenený fylogenetický strom je fylogenetický diagram, ktorému chýba spoločný predok alebo bazálny uzol. Tento typ stromu nenaznačuje pôvod evolúcie záujmových skupín. Zobrazuje iba vzťah medzi organizmami bez ohľadu na smer evolučnej časovej línie. Preto je ťažké študovať evolučné vzťahy skupín s ohľadom na čas pomocou nezakoreneného stromu.
Existujú dva hlavné spôsoby zakorenenia nezakoreneného fylogenetického stromu. Sú
Hľadanie vonkajšej skupiny – To si vyžaduje predchádzajúce znalosti o vzťahoch medzi taxónmi. Potom sa taxón, ktorý leží mimo skupiny, môže použiť ako mimoskupina na nakreslenie zakoreneného fylogenetického stromu
Hľadanie stredu alebo vzdialenosti – Stred dvoch najvzdialenejších taxónov v strome možno považovať za koreň fylogenetického stromu
Obrázok 02: Nezakorenený fylogenetický strom
Aký je rozdiel medzi zakoreneným a nezakoreneným fylogenetickým stromom?
Zakorenený verzus nezakorenený fylogenetický strom |
|
| Zakorenený fylogenetický strom je diagram, ktorý zobrazuje posledného spoločného predka skupín. | Nezakorenený fylogenetický strom ukazuje vzťahy medzi organizmami bez toho, aby ukazoval spoločného predka. |
| Node | |
| Má uzol (koreň). | Nemá uzol. |
| Smer evolúcie | |
| Má smer na označenie evolučného času. | Nešpecifikuje evolučný vzťah. |
| Postoj k druhým | |
| Strom umožňuje určiť vzťah predok – potomok medzi skupinami. | Strom neumožňuje hovoriť o vzťahu predok – potomok. |
Zhrnutie – zakorenený verzus nezakorenený fylogenetický strom
Fylogenetický strom predstavuje evolučné cesty a spojenia medzi organizmami pomocou rozvetvených diagramov podobných stromom. Fylogenetický stres môže byť zakorenený alebo nezakorenený. Zakorenený strom má na základni uzol, ktorý predstavuje spoločného predka, ktorý spája všetky záujmové skupiny. Nezakorenený strom ukazuje vzťahy medzi organizmami. Nezobrazuje však spoločného predka, ktorého zdieľajú všetky skupiny. Toto je rozdiel medzi zakoreneným a nezakoreneným fylogenetickým stromom.
