Kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou je v tom, že VNTR je krátka nukleotidová sekvencia vyskytujúca sa ako tandemové opakovanie v genóme, zatiaľ čo sonda je umelo syntetizovaná krátka sekvencia DNA alebo RNA, ktorá by mohla byť rádioaktívne označená.
VNTR znamená tandemové opakovanie s variabilným číslom. Je to krátka nukleotidová sekvencia organizovaná v tandemových opakovaniach v genóme. VNTR sa prirodzene vyskytujú v našom genóme. Sonda je umelo syntetizovaná krátka sekvencia DNA alebo RNA. Sonda aj VNTR sú nukleové kyseliny alebo krátke nukleotidové sekvencie. Majú obrovské využitie v rôznych molekulárnych biologických technikách, hlavne vo forenzných štúdiách. VNTR a sonda zdieľajú niektoré podobnosti, ako aj rozdiely. Preto sa článok pokúša zdôrazniť rozdiel medzi VNTR a sondou.
Čo je VNTR?
VNTR je krátka nukleotidová sekvencia, ktorá existuje ako tandemová repetícia v našom genóme. VNTR sú prítomné v mnohých chromozómoch. Okrem toho sa VNTR medzi rôznymi jednotlivcami líšia od dĺžok, pretože počet opakovaní je u VNTR rôznych ľudí odlišný. V podstate je to kvôli alelám zdedeným po rodičoch. Preto používame VNTR hlavne na rodičovské identifikácie (dedenie) alebo na osobné účely. Podobne je možné ich využiť aj v genetike, forenznom, biologickom výskume a pri snímaní odtlačkov DNA. Preto je VNTR dôležitým nástrojom v molekulárnej biológii.
Obrázok 01: VNTR
Pri dedení analyzujeme údaje VNTR pomocou dvoch základných princípov: párovanie dedičnosti a párovanie identity. Počas dedičného párovania musí mať jedinec zhodnú alelu s alelou každého rodiča. Počas párovania identity musia byť obe alely VNTR prítomné na špecifickom mieste genómu.
Čo je sonda?
V kontexte molekulárnej biológie je sonda umelo syntetizovaný fragment DNA alebo RNA s dĺžkou 100 až 1000 báz. Tieto sondy môžeme rádioaktívne označiť. Preto ich používame pri detekcii cieľových nukleotidových sekvencií, ktoré sú komplementárne so sekvenciou sondy. Keď do vzorky pridáme sondy, uskutoční sa hybridizácia s komplementárnymi sekvenciami alebo cieľovými sekvenciami a uľahčí nám identifikáciu cieľových sekvencií. Keďže sondy nesú rádioaktivitu, môžeme ich ľahko odhaliť.
Obrázok 02: Sonda
Vo forenznej vede bežne používame sondy v technikách profilovania DNA, ako je detekcia krátkych oblastí tandemových opakovaní, polymorfizmy dĺžky restrikčných fragmentov a DNA fingerprinting.
Aké sú podobnosti medzi VNTR a Probe?
- Nukleové kyseliny sú stavebnými kameňmi VNTR a Probe.
- Používame ich v procesoch identifikácie génov.
- Aj ich dĺžky sú variabilné.
- Sú dôležitými nástrojmi vo forenzných štúdiách, DNA fingerprinting, genetike atď.
Aký je rozdiel medzi VNTR a Probe?
VNTR je oblasť genómu organizovaná ako tandemové opakovania, zatiaľ čo sonda je krátka sekvencia DNA alebo RNA syntetizovaná umelo za účelom detekcie cieľových sekvencií vo vzorke. Toto je kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou. Dôležitým rozdielom medzi VNTR a sondou je aj to, že na rozdiel od VNTR môžeme sondy označiť rádioaktívne.
VNTR navyše väčšinou vykonávajú rodičovskú identifikáciu, zatiaľ čo sondy pomáhajú detegovať cieľové nukleotidové sekvencie vo vzorkách DNA alebo RNA, ktoré sú komplementárne so sekvenciou sondy. Preto je to tiež významný rozdiel medzi VNTR a sondou.
Nasledujúca infografika predstavuje viac informácií o rozdieloch medzi VNTR a sondou.
Zhrnutie – VNTR vs Probe
Bežné použitie VNTR a sondy je v technikách molekulárnej analýzy, ako sú forenzné štúdie a DNA fingerprinting. Obe pozostávajú z variabilných dĺžok. Kľúčový rozdiel medzi VNTR a sondou je však v tom, že VNTR je oblasť genómu usporiadaná s tandemovými opakovaniami, zatiaľ čo sonda je fragment DNA alebo RNA, ktorý by mohol byť rádioaktívne označený. Okrem toho sú v genóme prítomné VNTR. Sondy sú však umelo syntetizované a mohli by byť označené rádioaktívne, aby sa detegovali cieľové nukleotidové sekvencie vo vzorkách DNA alebo RNA, ktoré sú komplementárne so sekvenciou v sonde. Toto je zhrnutie rozdielu medzi VNTR a sondou.
