Kľúčový rozdiel medzi protomérmi a kapsomérmi je v tom, že protoméry sú štruktúrne jednotky oligomérnych proteínov, zatiaľ čo kapsoméry sú jednotlivé proteíny zložené z protomérov, ktoré sú štrukturálnymi podjednotkami vírusovej kapsidy.
Vírus je intracelulárny obligátny parazit, ktorý je infekčnou časticou. Kapsida je jednou z dvoch hlavných zložiek vírusovej častice. Je to proteínový obal, ktorý obklopuje a chráni vírusový genóm. Kapsida pozostáva z protomérov, ktoré sú štruktúrnymi jednotkami oligomérnych proteínov. Kapsomera je štrukturálna podjednotka vírusovej kapsidy a je to agregácia niekoľkých protomérov ako jednotky. Protoméry sa samy zostavujú, aby vytvorili kapsoméru a kapsoméry sa zostavili a vytvorili kapsid.
Čo sú Protomeri?
Protoméry sú štrukturálne jednotky oligomérnych proteínov. Protomér obsahuje aspoň dva rôzne polypeptidové reťazce. Častejšie obsahujú niekoľko polypeptidov. Vo vírusových kapsidách sa protoméry samozostavujú a vytvárajú kapsoméry, čo sú morfologické jednotky kapsidov. Protoméri sa navzájom spájajú prostredníctvom špecifických väzieb a sami sa zostavujú.
Obrázok 01: Protomers
Vo víruse tabakovej mozaiky sa protoméry zhlukujú a vytvoria dvojvrstvový disk, ktorý obalí genóm RNA. Tieto protoméry vírusu tabakovej mozaiky tak nakoniec vytvoria dlhú tuhú dutú trubicu, ktorá jej dodáva špirálovitý vzhľad. V ikozaedrickej symetrii sa protoméry agregujú do jednotiek piatich alebo šiestich kapsomérov a potom kondenzujú do 20 plôch rovnostranných trojuholníkov a 20 vrcholov.
Čo sú kapsomery?
Kapsoméry sú štrukturálne proteínové podjednotky vírusovej kapsidy. Sú tiež morfologickými podjednotkami vírusov. Štrukturálne je kapsida zostavou kapsomérov. Každá kapsoméra má niekoľko protomérov, ktoré sú navzájom zostavené. Okrem toho sú kapsoméry v kapside usporiadané odlišne, aby poskytli tvar vírusovej kapside. V tomto ohľade sú špirálové, ikosaedrické a komplexné tri typy usporiadania kapsomérov vo vírusoch. Usporiadanie kapsomérov je však charakteristické pre konkrétny vírus. Kapsoméry sa navzájom spájajú prostredníctvom interkapsomérnych triplexov zložených z dvoch kópií jedného proteínu a jednej kópie druhého.
Obrázok 02: Capsomeres
Navyše, každý vírus má konečný počet kapsomérov. Vírus hepatitídy B má ikosaedrickú kapsidu obsahujúcu 180 kapsomérov. Rekombinantný adenovírus má kapsid obsahujúci 252 kapsomérov. Herpesvírusy majú vo svojich kapsidách 162 kapsomérov. Okrem toho má enterovírus vo svojej kapside 60 kapsomérov. Podobne, rôzne vírusy majú rôzny počet kapsomérov vo svojom proteínovom obale.
Kapsoméry plnia vo vírusoch niekoľko funkcií. Kapsoméry chránia vírusový genóm pred fyzikálnym, chemickým a enzymatickým poškodením. Okrem toho sú kapsoméry dôležité pri zavádzaní vírusového genómu do hostiteľa tým, že sa ľahko adsorbujú na povrchy hostiteľských buniek.
Aké sú podobnosti medzi protomérmi a kapsomérmi?
- Protoméry a kapsoméry sú proteínové štruktúry.
- Protoméry sú podjednotky kapsomérov, zatiaľ čo kapsoméry sú podjednotky vírusovej kapsidy.
- Protoméry aj kapsoméry sa môžu samy zostaviť.
Aký je rozdiel medzi protomérmi a kapsomérmi?
Protoméry sú štrukturálne jednotky, ktoré tvoria oligomérne proteíny, zatiaľ čo kapsoméry sú morfologické jednotky vírusových kapsidov. Toto je kľúčový rozdiel medzi protomérmi a kapsomérmi. Okrem toho protoméry agregujú za vzniku kapsomérov, zatiaľ čo kapsoméry agregujú za vzniku kapsid.
Infografika nižšie sumarizuje rozdiel medzi protomérmi a kapsomérmi.
Zhrnutie – Protomers vs Capsomeres
Protoméry sú podjednotky kapsomérov, zatiaľ čo kapsoméry sú proteínové podjednotky vírusovej kapsidy. Kapsoméra je teda agregáciou protomérov, zatiaľ čo kapsid je agregáciou kapsomér. Usporiadanie protomérov alebo usporiadanie kapsomér dáva konkrétnemu vírusu tvar alebo symetriu. Na základe usporiadania kapsomérov sú špirálové a ikosaedrické dva tvary alebo symetrie pozorované vo vírusoch. Toto sumarizuje rozdiel medzi protomérmi a kapsomérmi.