Kľúčový rozdiel medzi PARP1 a PARP2 je v tom, že rastlinná a živočíšna PARP1 nesú väzbové motívy DNA Zn prsta, zatiaľ čo rastlinná PARP2 nesie N-terminálne väzbové motívy SAP DNA.
Poly ADP ribóza polymeráza (PARP) je rodina proteínov, ktoré sú jadrovými enzýmami. V rodine PARP existuje 17 rôznych typov enzýmov PARP. PARP1 a PARP2 sú dva enzýmy nevyhnutné pre normálnu opravu DNA.
Čo je PARP?
PARP (Poly ADP ribóza polymeráza) je rodina proteínov, ktoré slúžia v mnohých bunkových procesoch, ako je oprava DNA, genómová stabilita a programovaná bunková smrť. Katalyzujú proces nazývaný ADP-ribozylácia. ADP-ribozylácia označuje pridanie ADP-ribózových jednotiek z nikotínamidadeníndinukleotidu (NAD) k cieľovým substrátom, aby sa opravili prerušenia reťazca DNA.
enzýmy PARP sú proteíny viažuce DNA. Sú aktivované zárezmi prítomnými v molekulách DNA. Akonáhle sa naviažu zlomami DNA, hydrolyzujú NAD+ na nikotínamid a podporujú polymerizáciu ADP-ribózy. Preto sa jadrové enzýmy PARP podieľajú na oprave DNA. Okrem toho poly-ADP-ribozylácia funguje ako post-translačná modifikácia, ktorá hrá kľúčovú úlohu pri replikácii, transkripčnej regulácii, udržiavaní telomér a degradácii proteínov. Enzýmy PARP sa tiež podieľajú na udržiavaní stability genómu, regulácii štruktúry chromatínu, bunkovej proliferácii a apoptóze.
Čo je PARP1?
PARP1 je členom rodiny proteínov PARP. Je to prvý a najlepšie charakterizovaný proteín v tejto rodine. Pôsobí ako prvá odpoveď, ktorá deteguje poškodenie DNA a následne uľahčuje výber opravného mechanizmu. Okrem toho PARP1 reguluje opravu poškodení jednovláknovej DNA.
Obrázok 01: PARP1
Okrem opravy zlomov jednovláknovej DNA reguluje PARP1 progresiu a reštart replikačnej vidlice. Okrem toho podporuje alternatívne nehomologické spájanie koncov.
Čo je PARP2?
PARP2 je ďalším členom rodiny proteínov PARP. Úzko súvisí s enzýmom PARP1. Gén PARP2 kóduje proteín PARP2 u ľudí. PARP2 má katalytickú doménu, ale nemá N-koncovú DNA väzbovú doménu. Protirakovinové inhibítory PARP môžu inhibovať PARP2, podobne ako PARP1.
Obrázok 02: PARP2
V rastlinách, najmä v Arabidopsis thaliana, PARP2 hrá významnú úlohu v ochranných reakciách na poškodenie DNA a bakteriálnej patogenéze ako PARP1.
Aké sú podobnosti medzi PARP1 a PARP2?
- PARP1 a PARP2 sú dva typy jadrových enzýmov.
- Používajú NAD+ ako substrát na katalýzu poly ADP ribozylácie.
- Obidve sú aktivované jednovláknovými zlomami DNA.
- Cicavčie PARP1 a PARP2 sa nachádzajú v jadre.
- Parp1 aj PARP2 interagujú s chromatínom.
- Opravujú poškodenia DNA.
- Niektoré protirakovinové inhibítory PARP zamerané na PARP1 inhibujú aj PARP2.
Aký je rozdiel medzi PARP1 a PARP2?
PARP1 je členom rodiny proteínov PARP, ktorá má katalytickú doménu a N-terminálnu DNA väzbovú doménu, zatiaľ čo PARP2 je členom rodiny PARP, ktorej chýba N-terminálna DNA väzbová doména. Kľúčový rozdiel medzi PARP1 a PARP2 je v tom, že rastlinný a živočíšny PARP1 nesú väzbové motívy DNA Zn-prst, zatiaľ čo rastlinný PARP2 nesie N-terminálne väzbové motívy SAP DNA.
Nasledujúca infografika sumarizuje rozdiel medzi PARP1 a PARP2.
Zhrnutie – PARP1 vs PARP2
PARPs sú jadrové enzýmy, ktoré snímajú poškodenia DNA a opravujú ich. PARP1 a PARP2 sú dve z nich, ktoré spolu úzko súvisia. Oba enzýmy majú katalytickú doménu. PARP2 však chýba N-terminálna DNA väzbová doména, ktorá je prítomná v PARP1. Toto je kľúčový rozdiel medzi PARP1 a PARP2. Oba typy enzýmov používajú ako substrát NAD+.
