Kľúčový rozdiel medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi je v tom, že izoschizoméry rozpoznávajú a štiepia rovnaké reštrikčné alebo rozpoznávacie miesto, zatiaľ čo izokaudoméry rozpoznávajú mierne odlišné reštrikčné miesta a štiepia sa na rovnakom mieste.
Reštrikčné enzýmy alebo reštrikčné endonukleázy sú typom nukleáz, ktoré štiepia dvojvláknovú DNA. Sú schopné rozpoznať špecifické sekvencie nazývané reštrikčné miesta, ktoré sú palindromického pôvodu. Baktérie produkujú reštrikčné enzýmy proti cudzím patogénom, najmä proti vírusom. Je to forma obranného mechanizmu, ktorý prejavujú baktérie. V závislosti od štruktúry enzýmu a povahy rezov existujú tri typy reštrikčných enzýmov ako reštrikčné enzýmy typu I, reštrikčné enzýmy typu II a reštrikčné enzýmy typu II. Navyše, v závislosti od biochemickej aktivity a zdroja izolácie existujú tri typy reštrikčných enzýmov ako izoschizoméry, neoschizoméry a izokaudoméry.
Čo sú izoschizoméry?
Izoschizoméry sú typom reštrikčného enzýmu, ktorý pochádza z rôznych zdrojov, ale rozpoznáva a štiepi rovnaké reštrikčné miesto v DNA. Preto majú dva izoschizoméry rovnaké rozpoznávacie miesto. Štiepi sa na rovnakom mieste, takže sú špecifické pre rovnakú rozpoznávaciu sekvenciu. Napríklad reštrikčné enzýmy Sphl a BbuI sú dva izoschizoméry, ktoré rozpoznávajú a štiepia na CGTAC/G.
Obrázok 01: Reštrikčný enzým
Ďalší pár izoschizomérov je HpaII a MspI. Obaja rozpoznávajú sekvenciu 5′-CCGG-3′ a štiepia DNA. Okrem toho Bsp EI a Acc III sú tiež izoschizoméry, ktoré pochádzajú z druhov Bacillus a Acinetobacter calcoaceticus, v danom poradí. Izolácia izoschizomérov sa môže uskutočniť z rôznych baktérií. Keďže pochádzajú z rôznych baktérií, ich reštrikčné podmienky sa môžu navzájom líšiť.
Čo sú izokaudoméry?
Izokaudoméry sú typom reštrikčného enzýmu, ktorý rozpoznáva mierne odlišné sekvencie, no štiepia sa na rovnakom mieste a vytvárajú rovnaké konce. Izokaudoméry tiež pochádzajú z rôznych baktérií. Sau3a a BamHI sú pár izokaudomérov. Po odštiepení toho istého miesta vytvárajú 5'-GATC-3' lepkavý koniec. Ďalším párom izokaudomérov je NcoI z Nocardia corallina a PagI z Pseudomonas alcaligenes. Tieto dva enzýmy sa tiež viažu v rôznych rozpoznávacích sekvenciách, ale štiepia sa na rovnakom mieste a vytvárajú rovnaké lepkavé konce. Preto sú vyrábané rezné konce navzájom kompatibilné a môžu sa navzájom spájať. XhoI, PspXI a SalI sú tiež izokaudoméry.
Aké sú podobnosti medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi?
- Izoschizoméry a izokaudoméry sú dva typy reštrikčných enzýmov.
- Dva izoschizoméry majú rovnaké miesto trávenia, podobne ako dva izokaudoméry, ktoré majú rovnaké miesto trávenia.
- Sú prokaryotického pôvodu.
- Obe majú miesto rozpoznávania reštrikcií aj miesto trávenia.
- Vyrábajú konce, ktoré sú navzájom kompatibilné.
- Okrem toho sú tieto enzýmy užitočnými nástrojmi v technológii rekombinantnej DNA.
Aký je rozdiel medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi?
Izoschizoméry sú reštrikčné enzýmy, ktoré rozpoznávajú rovnakú sekvenciu DNA a štiepia sa na rovnakom reštrikčnom mieste, zatiaľ čo izokaudoméry sú reštrikčné enzýmy, ktoré rozpoznávajú mierne odlišné sekvencie DNA, ale rezaním na rovnakom mieste vytvárajú rovnaké lepkavé konce. Toto je kľúčový rozdiel medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi.
Nižšie uvedená infografika znázorňuje rozdiel medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi.
Zhrnutie – izoschizoméry vs izokaudoméry
Izoschizoméry sú reštrikčné enzýmy, ktoré rozpoznávajú rovnakú sekvenciu DNA a štiepia sa na rovnakom mieste. Na druhej strane, izokaudoméry sú reštrikčné enzýmy, ktoré rozpoznávajú mierne odlišné sekvencie a štiepia sa na rovnakom mieste za vzniku rovnakých koncov. Toto je kľúčový rozdiel medzi izoschizomérmi a izokaudomérmi. Sphl, Bbul, HpaII a MspI je niekoľko príkladov izoschizomérov, zatiaľ čo Sau3a a BamHI sú dva príklady izokaudomérov. Izoschizoméry aj izokaudoméry sú prirodzene produkované baktériami.
