Kľúčový rozdiel medzi snRNA a snoRNA je v tom, že snRNA zahŕňa alternatívne zostrihanie pre-mRNA, zatiaľ čo snoRNA zahŕňa modifikáciu rRNA a tRNA, úpravu mRNA a imprinting genómu.
Malé RNA sú polymérne molekuly RNA, ktoré pozostávajú z menej ako 200 nukleotidov. Zvyčajne sú nekódované. Existujú medzi messengerovými RNA na prenášanie signálov. Malé RNA pochádzajú z dokonalej dvojvláknovej RNA, ktorá sa vyrába pôsobením RNA-dependentnej RNA polymerázy. Malé RNA hrajú dôležitú úlohu pri bunkovej diferenciácii, raste a proliferácii, apoptóze, metabolizme, migrácii a obrane. Preto sú malé RNA dôležitými a kritickými regulátormi vývoja a fyziológie. Malá jadrová RNA a malá jadrová RNA sú dve triedy malých molekúl RNA.
Čo je snRNA?
Malá jadrová RNA alebo snRNA je trieda malých molekúl RNA, ktoré sa nachádzajú v jadre eukaryotických buniek. Priemerná dĺžka snRNA je približne 150 nukleotidov. RNA polymeráza II alebo RNA polymeráza III prepisujú snRNA. Hlavnou funkciou snRNA je spracovanie pre-messenger RNA v jadre. Pomáhajú tiež regulovať transkripčné faktory alebo RNA polymerázu II a udržiavať teloméry.
Obrázok 01: Mechanizmus účinku malej RNA
Existujú dve triedy snRNA založené na spoločných sekvenčných znakoch a pridružených proteínových faktoroch, ako je napríklad RNA viažuci LSm proteín. Tieto dve triedy sú snRNA triedy Sm a snRNA triedy Lsm. SnRNA triedy Sm pozostáva z vysokého obsahu uridínu U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 a U12. RNA polymeráza II transkribuje snRNA triedy SM. Po transkripcii pre-snRNA zvyčajne dostávajú do jadra 7-metylguanozínový 5' uzáver. Potom sú cez jadrové póry exportované do cytoplazmy na ďalšie spracovanie. SnRNA triedy Lsm má vysoký obsah uridínu U6 a U6atac. RNA polymeráza III transkribuje snRNA triedy Lsm a neopúšťa jadro. Najbežnejšími komponentmi ľudskej snRNA sú U1 spliceozomálna RNA, U2 spliceozomálna RNA, U4 spliceozomálna RNA, U5 spliceozomálna RNA a U6 spliceozomálna RNA.
Čo je snoRNA?
Malá nukleárna RNA alebo snoRNA je trieda malých molekúl RNA, ktoré riadia chemické modifikácie v inej RNA, ako je ribozomálna RNA, transferová RNA a malá jadrová RNA. Každá molekula snoRNA je počas procesu modifikácie spojená s približne štyrmi jadrovými proteínmi v komplexe RNA/proteín. SnoRNA obsahuje antisense prvok, ktorý má okolo 10-20 nukleotidov. Tieto bázy sú komplementárne k sekvencii obklopujúcej nukleotidy, ktoré sa zameriavajú na modifikáciu v molekule pre-RNA.
Obrázok 02: Malá nukleárna RNA
Existujú dve triedy snoRNA. Sú to C/D box snoRNA a H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA je spojený s metyláciou a H/ACA box snoRNA je spojený s pseudo-uridyláciou. Každá molekula snoRNA pôsobí ako vodidlo pre jednu alebo dve modifikácie v cieľovej RNA. C/D box snoRNA obsahuje dva krátke konzervované sekvenčné motívy C a D, v blízkosti 5' a 3' koncov snoRNA. Krátke oblasti pozostávajúce z 5 nukleotidov sa usporiadajú pred C boxom a po smere od D boxu a tvoria štruktúru kmeňového boxu. Tým sa motívy škatúľ C a D dostávajú do tesnej blízkosti. Štruktúra kmeňového boxu je dôležitá pre správnu syntézu snoRNA a nukleárnu lokalizáciu. H/ACA box snoRNA má sekundárnu štruktúru, ktorá pozostáva z dvoch vláseniek a dvoch jednovláknových oblastí. Toto je všeobecne známe ako štruktúra vlásenka-záves-vlásenka-chvost. H/ACA box snoRNA tiež pozostáva z dvoch konzervovaných motívov H a ACA. Obidve sa nachádzajú v jednovláknových oblastiach. H box je v závese a ACA je v oblasti chvosta. Tri nukleotidy tvoria 3' koniec sekvencie.
Aké sú podobnosti medzi snRNA a snoRNA?
- snRNA a snoRNA sú malé RNA.
- Obe sú prítomné v eukaryotických bunkách.
- Obe sú nekódujúce molekuly RNA.
- Okrem toho sa podieľajú na úprave RNA počas procesu transkripcie.
Aký je rozdiel medzi snRNA a snoRNA?
snRNA sa podieľa na alternatívnom zostrihu pre-mRNA, zatiaľ čo snoRNA modifikuje hlavne molekuly RNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi snRNA a snoRNA. Okrem toho majú snRNA dĺžku asi 150 nukleotidov a často sa nachádzajú spojené so skupinou proteínov a komplexov nazývaných malé jadrové ribonukleoproteíny. snoRNA majú dĺžku asi 60-170 nukleotidov a nachádzajú sa hlavne v jadierku.
Navyše, snRNA sú transkribované buď RNA polymerázou II alebo RNA polymerázou III, zatiaľ čo snoRNA je transkribované iba RNA polymerázou II.
Nižšie uvedená infografika predstavuje rozdiely medzi snRNA a snoRNA v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – snRNA vs snoRNA
snRNA a snoRNA sú triedy malých molekúl RNA. snRNA sa podieľa na alternatívnom zostrihu pre-mRNA, zatiaľ čo snoRNA modifikuje hlavne molekuly RNA. Toto je kľúčový rozdiel medzi snRNA a snoRNA. Malé RNA sú polymérne molekuly RNA, ktoré pozostávajú z menej ako 200 nukleotidov a sú zvyčajne nekódujúce. snRNA sa nachádzajú v jadre eukaryotov. snoRNA sa nachádzajú v archaea a eukaryotoch. Transkripcia snRNA sa uskutočňuje prostredníctvom RNA polymerázy II a II, zatiaľ čo iba RNA polymeráza II sa podieľa na transkripcii snoRNA. Toto sumarizuje rozdiel medzi snRNA a snoRNA.
