Kľúčový rozdiel medzi fykokyanínom a alofykokyanínom je v tom, že fykokyanín absorbuje a vyžaruje na kratších vlnových dĺžkach ako alofykokyanín.
Fykobiliproteíny sú rodinou vo vode rozpustných proteínov, ktoré sú prítomné v cyanobaktériách a niektorých druhoch rias. Fykocyanín a alofykokyanín sú dvaja hlavní členovia tejto rodiny.
Čo je fykocyanín?
Fykocyanín je pigmentovo-proteínový komplex z rodiny svetlozberných fykobiliproteínov. Ďalšími dôležitými členmi tejto rodiny sú alofykokyanín a fykoerytrín. Tento pigment je doplnkovým pigmentom chlorofylu. Vo všeobecnosti sú všetky fykobiliproteíny vo vode rozpustné komplexy, ktoré nemôžu existovať v membránach ako karotenoidy. Namiesto toho, aby existovali v membránach, tieto pigmenty majú tendenciu agregovať a vytvárať zhluky, ktoré môžu priľnúť k membránam známym ako fykobilizómy.
Obrázok 01: Extrahované fykokyanínové pigmenty (z cyanobaktérií)
Môžeme pozorovať, že fykocyanín má charakteristickú svetlomodrú farbu, ktorá dokáže absorbovať oranžové a červené svetlo (okolo 620 nm) a môže vyžarovať fluorescenciu (okolo 650 nm). Tento farebný pigment nájdeme v cyanobaktériách a názov „Phycocyanin“pochádza z gréckeho významu pre „Phyco“, čo znamená „riasy“a prípona „cyanin“z gréckeho významu pre „Kyanos“, čo znamená „tmavomodrá“.
Molekuly fykocyanínu majú zvyčajne spoločnú štruktúru so všetkými fykobiliproteínmi. Pri zvažovaní štruktúry tohto pigmentu sa začína zostavovaním fykobiliproteínových monomérov. Tieto monoméry sú heterodiméry pozostávajúce z alfa a beta podjednotiek s ich príslušnými chromofórmi. Chromofóry a podjednotky sú spojené chemickou väzbou tioéteru.
Podjednotky štruktúry fykokyanínu zvyčajne obsahujú osem alfa-helixov. Štruktúry monomérov majú tendenciu spontánne agregovať za vzniku kruhových trimérov, ktoré majú rotačnú symetriu a centrálny kanál. Okrem toho majú triméry tendenciu agregovať sa v pároch, pričom vytvárajú hexaméry, ktoré sú podporované ďalšími linkerovými proteínmi. Preto každá tyčinka fykobilizómu obsahuje dva alebo viac hexamérov fykocyanínu.
Čo je alofykokyanín?
Alofykokyanín je proteínová molekula, ktorá pochádza z rodiny fykobiliproteínov a je doplnkovým pigmentom chlorofylu. Ďalší členovia tejto svetlozbernej rodiny fykobiliproteínov zahŕňajú fykocyanín, fykoerytrín a fykoerytrokyanín. Alofykokyanínové pigmenty môžu absorbovať a vyžarovať červené svetlo a tento pigment môžeme ľahko nájsť v cyanobaktériách a červených riasach.
Obrázok 02: Vzhľad alofykokyanínu v diagrame
Alofykokyanín môžeme izolovať z rôznych druhov červených alebo modrozelených rias. Tieto riasy produkujú mierne odlišné formy molekuly. Vo všeobecnosti molekula alofykokyanínu obsahuje dve rôzne podjednotky pomenované ako alfa a beta podjednotka. Každá podjednotka má jeden fykokyanobilínový chromofor.
Alofykokyanín má rôzne aplikácie; mnohé nástroje boli vyvinuté špeciálne pre alofykokyanín. Táto zložka sa napríklad bežne používa v imunotestoch vrátane FACS, prietokovej cytometrie atď.
Aké sú podobnosti medzi fykokyanínom a alofykokyanínom?
- Fykocyanín a alofykokyanín sú vo vode rozpustné proteíny
- Obaja patria do rodiny fykobiliproteínov.
Aký je rozdiel medzi fykokyanínom a alofykokyanínom?
Fykobiliproteíny sú rodinou vo vode rozpustných proteínov, ktoré sú prítomné v cyanobaktériách a niektorých druhoch rias. Fykocyanín a alofykokyanín sú dvaja hlavní členovia tejto rodiny. Kľúčový rozdiel medzi fykokyanínom a alofykokyanínom je v tom, že fykocyanín absorbuje a vyžaruje pri kratších vlnových dĺžkach ako alofykocyanín.
Infografika nižšie uvádza ďalšie rozdiely medzi fykokyanínom a alofykokyanínom v tabuľkovej forme na porovnanie vedľa seba.
Zhrnutie – fykocyanín vs alofykocyanín
Fykobiliproteíny sú rodinou vo vode rozpustných proteínov, ktoré sú prítomné v cyanobaktériách a niektorých druhoch rias. Fykocyanín a alofykokyanín sú dvaja hlavní členovia tejto rodiny. Kľúčový rozdiel medzi fykokyanínom a alofykokyanínom je v tom, že fykocyanín absorbuje a vyžaruje pri kratších vlnových dĺžkach ako alofykokyanín.
