siRNA vs miRNA
RNA sú veľmi dôležité molekuly, ktoré pomáhajú budovať život organizmov. Nedávno vedci objavili malé RNA nazývané RNA interferencia alebo RNAi, ktoré po transkripcii pôsobia na kontrolu génovej expresie. Dva hlavné typy malých RNA sú mikro RNA alebo miRNA a malé interferujúce RNA alebo siRNA. Tieto molekuly v podstate regulujú génovú expresiu potlačením cieľového génu. MiRNA aj siRNA majú veľmi podobné dráhy biogenézy, aj keď medzi nimi existujú určité rozdiely. Pôvod miRNA a siRNA je z molekúl dsRNA. Zrelé miRNA sú štrukturálne podobné molekulám siRNA.
miRNA
Mikro RNA alebo miRNA sú malé molekuly RNA, ktoré sprostredkujú poslednú kontrolu translačnej génovej regulácie. Deregulácia miRNA môže viesť k rozvoju rakoviny a iných chorôb. Preto je správna regulácia informácií zakódovaných v nekódujúcej oblasti miRNA veľmi kritická v mnohých základných bunkových procesoch.
siRNA
siRNA sa tiež označujú ako krátke interferujúce alebo umlčujúce RNA a sú tvorené dvojvláknovou RNA s 20 až 25 pármi báz. Hlavnou úlohou siRNA je interferovať s expresiou špecifických génov s komplementárnymi nukleotidovými sekvenciami. siRNA je tvorená krátkou dvojvláknovou RNA s fosforylovanými 5' koncami a hydroxylovanými 3' koncami s dvoma previsnutými nukleotidmi.
Aký je rozdiel medzi siRNA a miRNA?
• miRNA odvodená zo špecifických genómových lokusov, zatiaľ čo siRNA odvodená z mRNA, transpozónov, vírusov alebo heterochromatickej DNA.
• Syntéza miRNA sa spracováva z dlhších prekurzorových vlásenkových transkriptov (primárna jadrová miRNA sekvencia endonukleázou RNázy III), zatiaľ čo syntéza siRNA sa spracováva z dlhých bimolekulárnych duplexov RNA.
• Každá vlásenková prekurzorová molekula miRNA produkuje jeden duplex miRNA, zatiaľ čo každá prekurzorová molekula siRNA produkuje viacero duplexov siRNA.
• siRNA sekvencie sú zriedkavo konzervované, kým miRNA sekvencie sú dobre konzervované.
• Všetky bázy v siRNA prispievajú k jej cieľovej špecifickosti, zatiaľ čo iba 5' polovica miRNA prispieva k jej cieľovej špecifickosti.
• miRNA sa často viažu na 3' nepreloženú oblasť cieľových transkriptov, zatiaľ čo siRNA tvoria komplementárny duplex kdekoľvek pozdĺž cieľovej mRNA.
• miRNA špecifikuje „hetero- silencing“, zatiaľ čo siRNA sa používa na „auto silencing“.
• miRNA funguje ako signál na zabránenie translácii, zatiaľ čo siRNA fyzicky zabraňuje translácii.
