Kľúčový rozdiel – oligonukleotid vs polynukleotid
Nukleotidy sú základné štruktúrne jednotky, ktoré syntetizujú zložité polymérne formy DNA (nukleová kyselina deoxyribóza) a RNA (nukleová kyselina ribózy). Nukleotidy sú organické molekuly. Skladajú sa z troch základných podjednotiek: dusíkatej bázy, pentózového cukru (ribóza/deoxyribóza) a fosfátovej skupiny. DNA a RNA syntetizované z nukleotidov pôsobia ako základné biomolekuly v živom systéme. Existuje mnoho typov nukleotidov, vrátane oligonukleotidov a polynukleotidov. Oligonukleotidy sú krátke segmenty DNA a RNA s jedným alebo viacerými nukleotidovými monomérmi, zatiaľ čo polynukleotidy sú biopolyméry s 13 alebo viacerými nukleotidovými monomérmi. Toto je kľúčový rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi.
Čo je to oligonukleotid?
Krátke segmenty molekúl DNA a RNA sú známe ako oligonukleotidy. Sú široko používané v oblasti forenznej vedy, genetiky a výskumu. Oligonukleotidy sa môžu vyrábať procesom známym ako chemická syntéza na pevnej fáze v laboratóriu. Vyrábajú sa ako jednovláknové molekuly so sekvenciou, ktorá je špecifikovaná pre konkrétnu funkciu a je dôležitým aspektom v kontexte PCR (Polymerázová reťazová reakcia), DNA microarrays, Southern blot techniky, FISH (fluorescenčná in situ hybridizácia), syntézy umelé gény, produkcia DNA/RNA knižníc a fungujú ako molekulárne sondy.
Obrázok 01: Oligonukleotid
Oligonukleotidy sa prirodzene vyskytujú ako mikroRNA, malé molekuly RNA, ktoré regulujú génovú expresiu. Oligonukleotidy môžu byť tiež prítomné v dôsledku katabolizmu väčších nukleových kyselín. Celá molekula je charakterizovaná a vyvinutá sekvenciou nukleotidových zvyškov. Oligonukleotidy zložené z fragmentov DNA sa využívajú počas PCR, čo je proces, ktorým by sa nepatrné množstvo DNA mohlo amplifikovať do miliónov kópií. Oligonukleotidy tu pôsobia ako priméry, ktoré pomáhajú pri fungovaní DNA polymerázy. Chemicky alebo prirodzene modifikovaný nukleozid známy ako fosforamidit pôsobí ako hlavná zložka počas syntézy oligonukleotidov. Syntéza oligonukleotidového vlákna prebieha od 3' konca po 5' koniec v cyklickej dráhe označovanej ako syntetický cyklus. Po dokončení jedného syntetického cyklu sa do rastúceho reťazca pridá jeden nukleotid.
Čo je to polynukleotid?
Polynukleotidová molekula pozostáva z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov a označuje sa ako biopolymér. Monoméry sú naviazané na nukleotidový reťazec kovalentne. DNA a RNA sú príklady polynukleotidov. Najjednoduchším polynukleotidom v živom systéme je RNA (ribonukleová kyselina), ktorá obsahuje pentózový cukor ribózu. RNA sa skladá z jednovláknového polynukleotidu. Molekula sa skladá zo štyroch dusíkatých báz, adenínu, guanínu, cytozínu a uracilu. RNA je mnohých rôznych typov: mRNA (messenger RNA), rRNA (ribozomálna RNA), tRNA (transferová RNA).
Deoxyribózová nukleová kyselina (DNA) je ďalší polynukleotid, ktorý pozostáva z pentózového cukru deoxyribózy. Dusíkaté bázy sú adenín, guanín, tymín a cytozín a sú zložené z dvoch špirálovo usporiadaných polynukleotidových reťazcov. Adenínový pár s tymínom a guanínový pár s cytozínom. Toto sa označuje ako doplnkové párovanie báz.
Obrázok 02: Polynukleotid
Polynukleotidy, DNA aj RNA, sa prirodzene vyskytujú v živých organizmoch a používajú sa v biologických aj biochemických experimentoch. Polynukleotidy sa využívajú pri PCR a sekvenovaní DNA. Môžu byť syntetizované umelo pomocou oligonukleotidov. Na syntézu a predĺženie polynukleotidového vlákna sa pridajú nové nukleotidy a reťazec sa predĺži prítomnosťou polymerázových enzýmov.
Aké sú podobnosti medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi?
- Oligonukleotidy a polynukleotidy sú monoméry DNA a RNA
- Obaja sa podieľajú na mnohých genetických technikách vrátane FISH a PCR.
Aký je rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi?
Oligonukleotid vs polynukleotid |
|
| Oligonukleotid je fragment DNA alebo RNA, ktorý sa skladá z jedného alebo viacerých nukleotidových monomérov. | Polynukleotid je biopolymér, ktorý sa skladá z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov. |
| Veľkosť | |
| Oligonukleotid je kratší ako polynukleotid. | Polynukleotid je dlhší ako oligonukleotid. |
| Function | |
| Oligonukleotidy sa využívajú v genetických technikách, ako je FISH. PCR, DNA micro array. | Polynukleotidy sa používajú pri FISH, PCR, sekvenovaní DNA atď. |
Zhrnutie – Oligonukleotidy vs polynukleotidy
Nukleotidy sú dôležité biomolekuly, ktoré sa podieľajú na hlavných metabolických funkciách v živých systémoch. Sú to monoméry DNA aj RNA. Nukleotidy sú organické molekuly a skladajú sa z troch základných podjednotiek: dusíkatej bázy, pentózového cukru a fosfátovej skupiny. Oligonukleotidy a polynukleotidy sú dva dôležité typy nukleotidov. Obe molekuly sa využívajú v rôznych genetických technikách, vrátane FISH a PCR. Oligonukleotidy sú zložené z jedného alebo viacerých nukleotidových monomérov, zatiaľ čo polynukleotidy sú zložené z 13 alebo viacerých nukleotidových monomérov. Oligonukleotidy sú kratšie ako polynukleotidy. Toto je rozdiel medzi oligonukleotidmi a polynukleotidmi.
Stiahnuť PDF verziu oligonukleotidov vs polynukleotidy
Verziu tohto článku si môžete stiahnuť vo formáte PDF a použiť ju na offline účely podľa citácie. Stiahnite si PDF verziu tu Rozdiel medzi oligonukleotidom a polynukleotidom
