Kľúčový rozdiel medzi homodimérom a heterodimérom je v tom, že homodimér je proteín vyrobený z dvoch identických proteínov, zatiaľ čo heterodimér je proteín vyrobený z dvoch rôznych proteínov.
Proteín je biomolekula zložená z reťazcov aminokyselín. Proteínový dimér je kvartérna proteínová štruktúra vytvorená spojením dvoch proteínových monomérov alebo dvoch reťazcov aminokyselín. Vo všeobecnosti sa navzájom viažu nekovalentnými väzbami. Proteínové diméry sú buď homodiméry alebo heterodiméry. Homodimér má dva identické proteíny, ktoré sú nekovalentne viazané. Heterodimér má dva rôzne proteíny spojené dohromady. Táto interakcia proteínového diméru je dôležitá pri regulácii a katalýze.
Čo je homodimér?
Homodimér je typ proteínového diméru zložený z dvoch identických monomérov. Monoméry sa viažu nekovalentnými väzbami. Vo všeobecnosti existuje 18 priemerných počtov H väzieb v homodiméroch. Okrem toho je korelačný koeficient medzi H-väzbami a zvyškami rozhrania v homodiméri 0,85. Okrem toho maximálny počet H väzieb na zvyšok rozhrania homodiméru je 0,44. Nielen to, ale aj v homodiméroch je viac medzimolekulových väzieb H. Hustota H väzieb na zvyšok rozhrania je však v homodiméroch nižšia.
Obrázok 01: Homodimér
Keď uvažujeme o príkladoch homodimérov, RNA triedy 1 sú homodiméry. V tomto homodiméri je proteín R1 zodpovedný za redukciu nukleotidov, zatiaľ čo proteín R2 je zodpovedný za umiestnenie dvojželezného tyrozylového poľa. Ďalším proteínovým homodimérom je tyreoglobulín produkovaný štítnou žľazou. Xantín oxidáza a etanercept sú tiež proteínové homodiméry.
Čo je heterodimér?
Heterodimér je typ proteínového diméru zložený z dvoch neidentických monomérov. Inými slovami, heterodimér je proteín zložený z dvoch rôznych proteínových monomérov. Vo všeobecnosti existuje 12 stredných počtov H väzieb v heterodiméroch. Okrem toho je korelačný koeficient medzi H-väzbami a zvyškami rozhrania v heterodiméri 0,83. Okrem toho maximálny počet H väzieb na zvyšok rozhrania heterodiméru je 0,65. V porovnaní s homodimérmi je v heterodiméroch menej intermolekulárnych H väzieb. Hustota H väzieb na zvyšok rozhrania je však vyššia v heterodiméroch.
Obrázok 02: Heterodimér
Enzýmová reverzná transkriptáza je heterodimér zložený z dvoch rôznych reťazcov aminokyselín. Ďalším príkladom heterodiméru sú opioidné receptory. Tubulín je navyše heterodimérny proteín.
Aké sú podobnosti medzi homodimérom a heterodimérom?
- Homodimér a heterodimér sú dva typy proteínových stmievačov.
- Oba majú dva monoméry.
- Sú to kvartérne proteínové štruktúry.
- Diméry sú bežné pri katalýze a regulácii.
Aký je rozdiel medzi homodimérom a heterodimérom?
Homodimér je proteínový dimér zložený z dvoch identických proteínových monomérov, zatiaľ čo heterodimér je proteínový dimér zložený z dvoch rôznych proteínových monomérov. Toto je kľúčový rozdiel medzi homodimérom a heterodimérom. Okrem toho existuje 18 priemerných počtov H väzieb v homodiméroch, zatiaľ čo v heterodiméroch je 12 stredných počtov H väzieb.
Ďalší rozdiel medzi homodimérom a heterodimérom je v tom, že korelačný koeficient medzi H-väzbami a zvyškami rozhrania je 0,85 v homodiméroch, zatiaľ čo v heterodiméroch je 0,83.
Nižšie uvedená infografika rozdielu medzi homodimérom a heterodimérom ukazuje viac porovnaní medzi oboma dimérmi.
Zhrnutie – Homodimér vs Heterodimér
Proteínové diméry sú bežné pri katalýze a regulácii. Môžu to byť buď homodiméry alebo heterodiméry. Homodiméry sa skladajú z dvoch identických proteínových monomérov. Na rozdiel od toho sú heterodiméry zložené z dvoch neidentických proteínových monomérov. Toto je kľúčový rozdiel medzi homodimérom a heterodimérom.
